Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA9

Gtf2h1, General transcription factor IIH subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2h1Q9DBA9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf2h1Q9DBA9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf2h1Q9DBA9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf2h1Q9DBA9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2h1Q9DBA9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2h1Q9DBA9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2h1Q9DBA9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2h1Q9DBA9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2h1Q9DBA9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2h1Q9DBA9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2h1Q9DBA9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2h1Q9DBA9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2h1Q9DBA9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2h1Q9DBA9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2h1Q9DBA9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2h1Q9DBA9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2h1Q9DBA9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2h1Q9DBA9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2h1Q9DBA9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2h1Q9DBA9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2h1Q9DBA9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2h1Q9DBA9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2h1Q9DBA9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2h1Q9DBA9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2h1Q9DBA9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gtf2h1Q9DBA9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2h1Q9DBA9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2h1Q9DBA9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2h1Q9DBA9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2h1Q9DBA9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gtf2h1Q9DBA9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2h1Q9DBA9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2h1Q9DBA9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2h1Q9DBA9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2h1Q9DBA9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gtf2h1Q9DBA9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2h1Q9DBA9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2h1Q9DBA9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2h1Q9DBA9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2h1Q9DBA9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gtf2h1Q9DBA9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2h1Q9DBA9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2h1Q9DBA9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2h1Q9DBA9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gtf2h1Q9DBA9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2h1Q9DBA9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2h1Q9DBA9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2h1Q9DBA9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2h1Q9DBA9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2h1Q9DBA9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2h1Q9DBA9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2h1Q9DBA9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2h1Q9DBA9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2h1Q9DBA9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2h1Q9DBA9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2h1Q9DBA9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2h1Q9DBA9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2h1Q9DBA9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2h1Q9DBA9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2h1Q9DBA9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2h1Q9DBA9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2h1Q9DBA9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2h1Q9DBA9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2h1Q9DBA9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2h1Q9DBA9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2h1Q9DBA9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2h1Q9DBA9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2h1Q9DBA9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2h1Q9DBA9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2h1Q9DBA9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2h1Q9DBA9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2h1Q9DBA9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2h1Q9DBA9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2h1Q9DBA9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2h1Q9DBA9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2h1Q9DBA9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2h1Q9DBA9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2h1Q9DBA9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2h1Q9DBA9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2h1Q9DBA9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gtf2h1Q9DBA9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf2h1Q9DBA9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf2h1Q9DBA9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf2h1Q9DBA9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf2h1Q9DBA9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2h1Q9DBA9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2h1Q9DBA9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2h1Q9DBA9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2h1Q9DBA9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2h1Q9DBA9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2h1Q9DBA9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2h1Q9DBA9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2h1Q9DBA9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2h1Q9DBA9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2h1Q9DBA9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2h1Q9DBA9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2h1Q9DBA9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2h1Q9DBA9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2h1Q9DBA9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2h1Q9DBA9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms