Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nop56Q9D6Z1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nop56Q9D6Z1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nop56Q9D6Z1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nop56Q9D6Z1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nop56Q9D6Z1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nop56Q9D6Z1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nop56Q9D6Z1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nop56Q9D6Z1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nop56Q9D6Z1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nop56Q9D6Z1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nop56Q9D6Z1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nop56Q9D6Z1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nop56Q9D6Z1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nop56Q9D6Z1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nop56Q9D6Z1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nop56Q9D6Z1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nop56Q9D6Z1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nop56Q9D6Z1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nop56Q9D6Z1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nop56Q9D6Z1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nop56Q9D6Z1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nop56Q9D6Z1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nop56Q9D6Z1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nop56Q9D6Z1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nop56Q9D6Z1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nop56Q9D6Z1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nop56Q9D6Z1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nop56Q9D6Z1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nop56Q9D6Z1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nop56Q9D6Z1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nop56Q9D6Z1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nop56Q9D6Z1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nop56Q9D6Z1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nop56Q9D6Z1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nop56Q9D6Z1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nop56Q9D6Z1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nop56Q9D6Z1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nop56Q9D6Z1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nop56Q9D6Z1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nop56Q9D6Z1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nop56Q9D6Z1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nop56Q9D6Z1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nop56Q9D6Z1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nop56Q9D6Z1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nop56Q9D6Z1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nop56Q9D6Z1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop56Q9D6Z1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop56Q9D6Z1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop56Q9D6Z1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop56Q9D6Z1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop56Q9D6Z1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop56Q9D6Z1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop56Q9D6Z1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop56Q9D6Z1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nop56Q9D6Z1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nop56Q9D6Z1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nop56Q9D6Z1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nop56Q9D6Z1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nop56Q9D6Z1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nop56Q9D6Z1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nop56Q9D6Z1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nop56Q9D6Z1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nop56Q9D6Z1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nop56Q9D6Z1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nop56Q9D6Z1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nop56Q9D6Z1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nop56Q9D6Z1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nop56Q9D6Z1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nop56Q9D6Z1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nop56Q9D6Z1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nop56Q9D6Z1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nop56Q9D6Z1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nop56Q9D6Z1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nop56Q9D6Z1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nop56Q9D6Z1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nop56Q9D6Z1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nop56Q9D6Z1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nop56Q9D6Z1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nop56Q9D6Z1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nop56Q9D6Z1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nop56Q9D6Z1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nop56Q9D6Z1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nop56Q9D6Z1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nop56Q9D6Z1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nop56Q9D6Z1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nop56Q9D6Z1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nop56Q9D6Z1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nop56Q9D6Z1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nop56Q9D6Z1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nop56Q9D6Z1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nop56Q9D6Z1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nop56Q9D6Z1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nop56Q9D6Z1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nop56Q9D6Z1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nop56Q9D6Z1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nop56Q9D6Z1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nop56Q9D6Z1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nop56Q9D6Z1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nop56Q9D6Z1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms