Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cfap53Q9D439 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cfap53Q9D439 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cfap53Q9D439 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cfap53Q9D439 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cfap53Q9D439 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cfap53Q9D439 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cfap53Q9D439 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cfap53Q9D439 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cfap53Q9D439 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cfap53Q9D439 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cfap53Q9D439 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfap53Q9D439 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfap53Q9D439 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfap53Q9D439 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfap53Q9D439 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfap53Q9D439 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfap53Q9D439 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cfap53Q9D439 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cfap53Q9D439 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cfap53Q9D439 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cfap53Q9D439 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cfap53Q9D439 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cfap53Q9D439 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cfap53Q9D439 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cfap53Q9D439 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cfap53Q9D439 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cfap53Q9D439 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cfap53Q9D439 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cfap53Q9D439 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cfap53Q9D439 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cfap53Q9D439 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cfap53Q9D439 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cfap53Q9D439 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cfap53Q9D439 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cfap53Q9D439 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cfap53Q9D439 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cfap53Q9D439 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cfap53Q9D439 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cfap53Q9D439 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cfap53Q9D439 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cfap53Q9D439 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cfap53Q9D439 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cfap53Q9D439 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cfap53Q9D439 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cfap53Q9D439 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cfap53Q9D439 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms