Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hdac9Q99N13 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hdac9Q99N13 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Hdac9Q99N13 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hdac9Q99N13 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hdac9Q99N13 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Hdac9Q99N13 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Hdac9Q99N13 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hdac9Q99N13 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hdac9Q99N13 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hdac9Q99N13 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hdac9Q99N13 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Hdac9Q99N13 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hdac9Q99N13 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hdac9Q99N13 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hdac9Q99N13 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Hdac9Q99N13 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Hdac9Q99N13 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hdac9Q99N13 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hdac9Q99N13 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hdac9Q99N13 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hdac9Q99N13 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hdac9Q99N13 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Hdac9Q99N13 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hdac9Q99N13 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hdac9Q99N13 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hdac9Q99N13 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Hdac9Q99N13 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hdac9Q99N13 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hdac9Q99N13 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hdac9Q99N13 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hdac9Q99N13 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hdac9Q99N13 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hdac9Q99N13 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hdac9Q99N13 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hdac9Q99N13 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hdac9Q99N13 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hdac9Q99N13 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hdac9Q99N13 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hdac9Q99N13 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hdac9Q99N13 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hdac9Q99N13 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hdac9Q99N13 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hdac9Q99N13 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hdac9Q99N13 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hdac9Q99N13 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hdac9Q99N13 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hdac9Q99N13 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hdac9Q99N13 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hdac9Q99N13 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hdac9Q99N13 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hdac9Q99N13 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Hdac9Q99N13 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hdac9Q99N13 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hdac9Q99N13 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Hdac9Q99N13 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hdac9Q99N13 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hdac9Q99N13 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hdac9Q99N13 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hdac9Q99N13 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hdac9Q99N13 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hdac9Q99N13 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hdac9Q99N13 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hdac9Q99N13 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hdac9Q99N13 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hdac9Q99N13 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hdac9Q99N13 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hdac9Q99N13 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hdac9Q99N13 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hdac9Q99N13 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac9Q99N13 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac9Q99N13 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac9Q99N13 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac9Q99N13 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac9Q99N13 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac9Q99N13 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hdac9Q99N13 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Hdac9Q99N13 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hdac9Q99N13 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hdac9Q99N13 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hdac9Q99N13 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hdac9Q99N13 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hdac9Q99N13 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hdac9Q99N13 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hdac9Q99N13 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hdac9Q99N13 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hdac9Q99N13 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hdac9Q99N13 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hdac9Q99N13 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hdac9Q99N13 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hdac9Q99N13 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hdac9Q99N13 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Hdac9Q99N13 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hdac9Q99N13 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hdac9Q99N13 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hdac9Q99N13 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hdac9Q99N13 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hdac9Q99N13 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hdac9Q99N13 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hdac9Q99N13 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms