Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pramel1Q99MW3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pramel1Q99MW3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pramel1Q99MW3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pramel1Q99MW3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pramel1Q99MW3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pramel1Q99MW3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pramel1Q99MW3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pramel1Q99MW3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pramel1Q99MW3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Pramel1Q99MW3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pramel1Q99MW3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pramel1Q99MW3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pramel1Q99MW3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pramel1Q99MW3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pramel1Q99MW3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pramel1Q99MW3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pramel1Q99MW3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pramel1Q99MW3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pramel1Q99MW3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pramel1Q99MW3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pramel1Q99MW3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pramel1Q99MW3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pramel1Q99MW3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pramel1Q99MW3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pramel1Q99MW3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pramel1Q99MW3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pramel1Q99MW3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pramel1Q99MW3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pramel1Q99MW3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pramel1Q99MW3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pramel1Q99MW3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pramel1Q99MW3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pramel1Q99MW3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pramel1Q99MW3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pramel1Q99MW3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pramel1Q99MW3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pramel1Q99MW3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pramel1Q99MW3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pramel1Q99MW3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pramel1Q99MW3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pramel1Q99MW3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pramel1Q99MW3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pramel1Q99MW3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pramel1Q99MW3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pramel1Q99MW3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pramel1Q99MW3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pramel1Q99MW3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pramel1Q99MW3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pramel1Q99MW3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pramel1Q99MW3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pramel1Q99MW3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pramel1Q99MW3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pramel1Q99MW3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pramel1Q99MW3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pramel1Q99MW3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pramel1Q99MW3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pramel1Q99MW3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms