Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC8

Vwa5a, von Willebrand factor A domain-containing protein 5A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5aQ99KC8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Vwa5aQ99KC8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vwa5aQ99KC8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vwa5aQ99KC8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vwa5aQ99KC8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vwa5aQ99KC8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vwa5aQ99KC8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vwa5aQ99KC8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vwa5aQ99KC8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vwa5aQ99KC8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vwa5aQ99KC8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vwa5aQ99KC8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vwa5aQ99KC8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vwa5aQ99KC8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vwa5aQ99KC8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vwa5aQ99KC8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vwa5aQ99KC8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vwa5aQ99KC8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Vwa5aQ99KC8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vwa5aQ99KC8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vwa5aQ99KC8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vwa5aQ99KC8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vwa5aQ99KC8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vwa5aQ99KC8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vwa5aQ99KC8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vwa5aQ99KC8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vwa5aQ99KC8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vwa5aQ99KC8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vwa5aQ99KC8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vwa5aQ99KC8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Vwa5aQ99KC8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vwa5aQ99KC8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vwa5aQ99KC8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vwa5aQ99KC8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vwa5aQ99KC8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vwa5aQ99KC8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vwa5aQ99KC8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vwa5aQ99KC8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vwa5aQ99KC8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vwa5aQ99KC8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vwa5aQ99KC8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vwa5aQ99KC8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vwa5aQ99KC8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vwa5aQ99KC8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vwa5aQ99KC8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vwa5aQ99KC8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vwa5aQ99KC8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vwa5aQ99KC8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vwa5aQ99KC8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vwa5aQ99KC8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vwa5aQ99KC8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vwa5aQ99KC8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vwa5aQ99KC8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vwa5aQ99KC8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vwa5aQ99KC8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Vwa5aQ99KC8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vwa5aQ99KC8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vwa5aQ99KC8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vwa5aQ99KC8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vwa5aQ99KC8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vwa5aQ99KC8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vwa5aQ99KC8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vwa5aQ99KC8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vwa5aQ99KC8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vwa5aQ99KC8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vwa5aQ99KC8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vwa5aQ99KC8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Vwa5aQ99KC8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vwa5aQ99KC8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vwa5aQ99KC8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vwa5aQ99KC8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Vwa5aQ99KC8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vwa5aQ99KC8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vwa5aQ99KC8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vwa5aQ99KC8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vwa5aQ99KC8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vwa5aQ99KC8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vwa5aQ99KC8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vwa5aQ99KC8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vwa5aQ99KC8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vwa5aQ99KC8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vwa5aQ99KC8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vwa5aQ99KC8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vwa5aQ99KC8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vwa5aQ99KC8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vwa5aQ99KC8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vwa5aQ99KC8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vwa5aQ99KC8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vwa5aQ99KC8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vwa5aQ99KC8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vwa5aQ99KC8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vwa5aQ99KC8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vwa5aQ99KC8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vwa5aQ99KC8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vwa5aQ99KC8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vwa5aQ99KC8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vwa5aQ99KC8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vwa5aQ99KC8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vwa5aQ99KC8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Vwa5aQ99KC8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms