Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR8

Smarcd2, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd2Q99JR8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcd2Q99JR8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcd2Q99JR8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smarcd2Q99JR8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcd2Q99JR8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcd2Q99JR8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcd2Q99JR8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcd2Q99JR8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcd2Q99JR8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smarcd2Q99JR8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcd2Q99JR8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcd2Q99JR8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcd2Q99JR8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcd2Q99JR8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcd2Q99JR8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcd2Q99JR8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smarcd2Q99JR8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Smarcd2Q99JR8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcd2Q99JR8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcd2Q99JR8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcd2Q99JR8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smarcd2Q99JR8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcd2Q99JR8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcd2Q99JR8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcd2Q99JR8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcd2Q99JR8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcd2Q99JR8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcd2Q99JR8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcd2Q99JR8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcd2Q99JR8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smarcd2Q99JR8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcd2Q99JR8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcd2Q99JR8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Smarcd2Q99JR8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcd2Q99JR8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcd2Q99JR8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcd2Q99JR8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcd2Q99JR8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcd2Q99JR8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcd2Q99JR8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcd2Q99JR8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smarcd2Q99JR8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcd2Q99JR8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smarcd2Q99JR8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcd2Q99JR8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcd2Q99JR8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcd2Q99JR8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcd2Q99JR8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcd2Q99JR8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcd2Q99JR8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smarcd2Q99JR8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smarcd2Q99JR8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcd2Q99JR8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcd2Q99JR8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smarcd2Q99JR8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcd2Q99JR8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcd2Q99JR8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms