Protein–RNA interactions for Protein: Q922R0

Prkx, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit PRKX, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkxQ922R0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkxQ922R0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkxQ922R0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkxQ922R0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkxQ922R0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkxQ922R0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkxQ922R0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkxQ922R0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkxQ922R0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkxQ922R0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkxQ922R0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkxQ922R0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkxQ922R0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkxQ922R0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkxQ922R0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkxQ922R0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkxQ922R0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkxQ922R0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkxQ922R0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkxQ922R0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkxQ922R0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkxQ922R0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkxQ922R0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkxQ922R0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkxQ922R0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkxQ922R0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkxQ922R0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkxQ922R0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkxQ922R0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkxQ922R0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkxQ922R0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkxQ922R0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkxQ922R0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkxQ922R0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkxQ922R0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkxQ922R0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PrkxQ922R0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkxQ922R0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkxQ922R0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkxQ922R0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkxQ922R0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkxQ922R0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkxQ922R0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkxQ922R0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkxQ922R0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkxQ922R0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PrkxQ922R0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkxQ922R0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkxQ922R0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkxQ922R0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkxQ922R0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkxQ922R0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkxQ922R0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PrkxQ922R0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkxQ922R0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkxQ922R0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkxQ922R0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PrkxQ922R0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkxQ922R0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkxQ922R0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkxQ922R0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkxQ922R0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkxQ922R0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkxQ922R0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkxQ922R0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkxQ922R0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkxQ922R0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkxQ922R0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkxQ922R0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkxQ922R0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkxQ922R0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkxQ922R0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkxQ922R0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkxQ922R0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkxQ922R0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkxQ922R0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkxQ922R0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkxQ922R0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkxQ922R0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkxQ922R0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkxQ922R0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkxQ922R0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkxQ922R0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkxQ922R0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkxQ922R0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkxQ922R0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkxQ922R0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkxQ922R0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkxQ922R0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkxQ922R0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkxQ922R0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkxQ922R0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkxQ922R0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkxQ922R0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkxQ922R0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkxQ922R0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkxQ922R0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkxQ922R0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkxQ922R0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkxQ922R0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms