Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prpf6Q91YR7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prpf6Q91YR7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prpf6Q91YR7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prpf6Q91YR7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prpf6Q91YR7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prpf6Q91YR7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prpf6Q91YR7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf6Q91YR7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf6Q91YR7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf6Q91YR7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf6Q91YR7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf6Q91YR7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf6Q91YR7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf6Q91YR7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf6Q91YR7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf6Q91YR7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prpf6Q91YR7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prpf6Q91YR7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prpf6Q91YR7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Prpf6Q91YR7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prpf6Q91YR7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Prpf6Q91YR7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf6Q91YR7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf6Q91YR7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf6Q91YR7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf6Q91YR7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf6Q91YR7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf6Q91YR7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Prpf6Q91YR7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf6Q91YR7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf6Q91YR7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf6Q91YR7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf6Q91YR7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf6Q91YR7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf6Q91YR7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prpf6Q91YR7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prpf6Q91YR7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prpf6Q91YR7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prpf6Q91YR7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prpf6Q91YR7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf6Q91YR7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf6Q91YR7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf6Q91YR7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prpf6Q91YR7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prpf6Q91YR7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prpf6Q91YR7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prpf6Q91YR7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prpf6Q91YR7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prpf6Q91YR7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf6Q91YR7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prpf6Q91YR7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf6Q91YR7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf6Q91YR7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf6Q91YR7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf6Q91YR7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf6Q91YR7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf6Q91YR7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf6Q91YR7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Prpf6Q91YR7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prpf6Q91YR7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prpf6Q91YR7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prpf6Q91YR7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Prpf6Q91YR7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prpf6Q91YR7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prpf6Q91YR7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prpf6Q91YR7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prpf6Q91YR7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prpf6Q91YR7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prpf6Q91YR7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Prpf6Q91YR7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Prpf6Q91YR7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prpf6Q91YR7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prpf6Q91YR7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Prpf6Q91YR7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Prpf6Q91YR7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prpf6Q91YR7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prpf6Q91YR7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prpf6Q91YR7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prpf6Q91YR7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prpf6Q91YR7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Prpf6Q91YR7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf6Q91YR7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf6Q91YR7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf6Q91YR7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf6Q91YR7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf6Q91YR7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf6Q91YR7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf6Q91YR7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf6Q91YR7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf6Q91YR7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf6Q91YR7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf6Q91YR7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Prpf6Q91YR7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Prpf6Q91YR7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prpf6Q91YR7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prpf6Q91YR7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Prpf6Q91YR7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Prpf6Q91YR7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prpf6Q91YR7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms