Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y17

Pcdha2, Protocadherin alpha 2, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha2Q91Y17 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdha2Q91Y17 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdha2Q91Y17 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdha2Q91Y17 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdha2Q91Y17 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdha2Q91Y17 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdha2Q91Y17 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha2Q91Y17 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha2Q91Y17 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha2Q91Y17 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha2Q91Y17 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha2Q91Y17 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha2Q91Y17 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdha2Q91Y17 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdha2Q91Y17 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdha2Q91Y17 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdha2Q91Y17 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha2Q91Y17 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha2Q91Y17 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha2Q91Y17 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha2Q91Y17 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha2Q91Y17 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha2Q91Y17 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha2Q91Y17 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha2Q91Y17 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha2Q91Y17 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha2Q91Y17 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha2Q91Y17 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdha2Q91Y17 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdha2Q91Y17 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdha2Q91Y17 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha2Q91Y17 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha2Q91Y17 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha2Q91Y17 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha2Q91Y17 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha2Q91Y17 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha2Q91Y17 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha2Q91Y17 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha2Q91Y17 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha2Q91Y17 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha2Q91Y17 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha2Q91Y17 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha2Q91Y17 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdha2Q91Y17 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdha2Q91Y17 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdha2Q91Y17 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdha2Q91Y17 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdha2Q91Y17 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha2Q91Y17 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha2Q91Y17 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha2Q91Y17 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pcdha2Q91Y17 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha2Q91Y17 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha2Q91Y17 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdha2Q91Y17 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha2Q91Y17 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha2Q91Y17 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha2Q91Y17 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha2Q91Y17 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha2Q91Y17 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdha2Q91Y17 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcdha2Q91Y17 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pcdha2Q91Y17 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdha2Q91Y17 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdha2Q91Y17 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdha2Q91Y17 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdha2Q91Y17 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdha2Q91Y17 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdha2Q91Y17 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdha2Q91Y17 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pcdha2Q91Y17 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha2Q91Y17 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha2Q91Y17 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha2Q91Y17 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha2Q91Y17 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha2Q91Y17 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha2Q91Y17 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha2Q91Y17 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdha2Q91Y17 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdha2Q91Y17 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdha2Q91Y17 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdha2Q91Y17 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdha2Q91Y17 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdha2Q91Y17 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdha2Q91Y17 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdha2Q91Y17 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdha2Q91Y17 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdha2Q91Y17 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcdha2Q91Y17 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdha2Q91Y17 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcdha2Q91Y17 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha2Q91Y17 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha2Q91Y17 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha2Q91Y17 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha2Q91Y17 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcdha2Q91Y17 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdha2Q91Y17 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdha2Q91Y17 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdha2Q91Y17 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcdha2Q91Y17 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms