Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y11

Pcdha9, Protocadherin alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha9Q91Y11 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha9Q91Y11 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha9Q91Y11 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha9Q91Y11 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdha9Q91Y11 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdha9Q91Y11 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdha9Q91Y11 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdha9Q91Y11 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdha9Q91Y11 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdha9Q91Y11 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdha9Q91Y11 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdha9Q91Y11 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdha9Q91Y11 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdha9Q91Y11 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdha9Q91Y11 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdha9Q91Y11 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdha9Q91Y11 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdha9Q91Y11 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdha9Q91Y11 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdha9Q91Y11 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdha9Q91Y11 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdha9Q91Y11 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdha9Q91Y11 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdha9Q91Y11 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdha9Q91Y11 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdha9Q91Y11 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdha9Q91Y11 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdha9Q91Y11 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdha9Q91Y11 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdha9Q91Y11 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdha9Q91Y11 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdha9Q91Y11 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdha9Q91Y11 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdha9Q91Y11 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdha9Q91Y11 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdha9Q91Y11 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdha9Q91Y11 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdha9Q91Y11 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdha9Q91Y11 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdha9Q91Y11 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdha9Q91Y11 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdha9Q91Y11 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdha9Q91Y11 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdha9Q91Y11 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdha9Q91Y11 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdha9Q91Y11 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdha9Q91Y11 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdha9Q91Y11 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdha9Q91Y11 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdha9Q91Y11 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdha9Q91Y11 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdha9Q91Y11 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcdha9Q91Y11 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcdha9Q91Y11 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms