Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIK1

Snrnp25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp25Q8VIK1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snrnp25Q8VIK1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snrnp25Q8VIK1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snrnp25Q8VIK1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Snrnp25Q8VIK1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snrnp25Q8VIK1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Snrnp25Q8VIK1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snrnp25Q8VIK1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snrnp25Q8VIK1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snrnp25Q8VIK1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrnp25Q8VIK1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrnp25Q8VIK1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrnp25Q8VIK1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrnp25Q8VIK1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrnp25Q8VIK1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snrnp25Q8VIK1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snrnp25Q8VIK1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snrnp25Q8VIK1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snrnp25Q8VIK1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snrnp25Q8VIK1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snrnp25Q8VIK1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snrnp25Q8VIK1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snrnp25Q8VIK1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snrnp25Q8VIK1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snrnp25Q8VIK1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snrnp25Q8VIK1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snrnp25Q8VIK1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snrnp25Q8VIK1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snrnp25Q8VIK1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snrnp25Q8VIK1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snrnp25Q8VIK1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snrnp25Q8VIK1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snrnp25Q8VIK1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snrnp25Q8VIK1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snrnp25Q8VIK1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snrnp25Q8VIK1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snrnp25Q8VIK1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snrnp25Q8VIK1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snrnp25Q8VIK1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snrnp25Q8VIK1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snrnp25Q8VIK1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snrnp25Q8VIK1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snrnp25Q8VIK1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snrnp25Q8VIK1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snrnp25Q8VIK1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snrnp25Q8VIK1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snrnp25Q8VIK1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snrnp25Q8VIK1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snrnp25Q8VIK1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snrnp25Q8VIK1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snrnp25Q8VIK1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snrnp25Q8VIK1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snrnp25Q8VIK1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snrnp25Q8VIK1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snrnp25Q8VIK1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snrnp25Q8VIK1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Snrnp25Q8VIK1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Snrnp25Q8VIK1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Snrnp25Q8VIK1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snrnp25Q8VIK1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snrnp25Q8VIK1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snrnp25Q8VIK1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snrnp25Q8VIK1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snrnp25Q8VIK1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snrnp25Q8VIK1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snrnp25Q8VIK1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snrnp25Q8VIK1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snrnp25Q8VIK1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snrnp25Q8VIK1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snrnp25Q8VIK1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snrnp25Q8VIK1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snrnp25Q8VIK1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Snrnp25Q8VIK1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snrnp25Q8VIK1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snrnp25Q8VIK1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snrnp25Q8VIK1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snrnp25Q8VIK1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snrnp25Q8VIK1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snrnp25Q8VIK1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snrnp25Q8VIK1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snrnp25Q8VIK1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snrnp25Q8VIK1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snrnp25Q8VIK1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snrnp25Q8VIK1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snrnp25Q8VIK1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snrnp25Q8VIK1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snrnp25Q8VIK1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snrnp25Q8VIK1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snrnp25Q8VIK1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snrnp25Q8VIK1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snrnp25Q8VIK1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms