Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHS2

Crb1, Protein crumbs homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb1Q8VHS2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Crb1Q8VHS2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
Crb1Q8VHS2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Crb1Q8VHS2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Crb1Q8VHS2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Crb1Q8VHS2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Crb1Q8VHS2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Crb1Q8VHS2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Crb1Q8VHS2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Crb1Q8VHS2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Crb1Q8VHS2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Crb1Q8VHS2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Crb1Q8VHS2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Crb1Q8VHS2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Crb1Q8VHS2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Crb1Q8VHS2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Crb1Q8VHS2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Crb1Q8VHS2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Crb1Q8VHS2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Crb1Q8VHS2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Crb1Q8VHS2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Crb1Q8VHS2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Crb1Q8VHS2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Crb1Q8VHS2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Crb1Q8VHS2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Crb1Q8VHS2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Crb1Q8VHS2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Crb1Q8VHS2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Crb1Q8VHS2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Crb1Q8VHS2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Crb1Q8VHS2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Crb1Q8VHS2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Crb1Q8VHS2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Crb1Q8VHS2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Crb1Q8VHS2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Crb1Q8VHS2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Crb1Q8VHS2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Crb1Q8VHS2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Crb1Q8VHS2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Crb1Q8VHS2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Crb1Q8VHS2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Crb1Q8VHS2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Crb1Q8VHS2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Crb1Q8VHS2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Crb1Q8VHS2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Crb1Q8VHS2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Crb1Q8VHS2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Crb1Q8VHS2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Crb1Q8VHS2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Crb1Q8VHS2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Crb1Q8VHS2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Crb1Q8VHS2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Crb1Q8VHS2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Crb1Q8VHS2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Crb1Q8VHS2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Crb1Q8VHS2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Crb1Q8VHS2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Crb1Q8VHS2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Crb1Q8VHS2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Crb1Q8VHS2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Crb1Q8VHS2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Crb1Q8VHS2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Crb1Q8VHS2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Crb1Q8VHS2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Crb1Q8VHS2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Crb1Q8VHS2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Crb1Q8VHS2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Crb1Q8VHS2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Crb1Q8VHS2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Crb1Q8VHS2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Crb1Q8VHS2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Crb1Q8VHS2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Crb1Q8VHS2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Crb1Q8VHS2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Crb1Q8VHS2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Crb1Q8VHS2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Crb1Q8VHS2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Crb1Q8VHS2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Crb1Q8VHS2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Crb1Q8VHS2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Crb1Q8VHS2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Crb1Q8VHS2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Crb1Q8VHS2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Crb1Q8VHS2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Crb1Q8VHS2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Crb1Q8VHS2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Crb1Q8VHS2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Crb1Q8VHS2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Crb1Q8VHS2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Crb1Q8VHS2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Crb1Q8VHS2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Crb1Q8VHS2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Crb1Q8VHS2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Crb1Q8VHS2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Crb1Q8VHS2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Crb1Q8VHS2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Crb1Q8VHS2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Crb1Q8VHS2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Crb1Q8VHS2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Crb1Q8VHS2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms