Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT1

Txlnb, Beta-taxilin, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TxlnbQ8VBT1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TxlnbQ8VBT1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TxlnbQ8VBT1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TxlnbQ8VBT1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TxlnbQ8VBT1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TxlnbQ8VBT1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TxlnbQ8VBT1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TxlnbQ8VBT1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TxlnbQ8VBT1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TxlnbQ8VBT1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TxlnbQ8VBT1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TxlnbQ8VBT1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TxlnbQ8VBT1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TxlnbQ8VBT1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TxlnbQ8VBT1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TxlnbQ8VBT1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TxlnbQ8VBT1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TxlnbQ8VBT1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
TxlnbQ8VBT1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TxlnbQ8VBT1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TxlnbQ8VBT1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TxlnbQ8VBT1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TxlnbQ8VBT1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TxlnbQ8VBT1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TxlnbQ8VBT1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TxlnbQ8VBT1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TxlnbQ8VBT1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TxlnbQ8VBT1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TxlnbQ8VBT1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TxlnbQ8VBT1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TxlnbQ8VBT1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TxlnbQ8VBT1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TxlnbQ8VBT1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TxlnbQ8VBT1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TxlnbQ8VBT1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TxlnbQ8VBT1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TxlnbQ8VBT1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TxlnbQ8VBT1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TxlnbQ8VBT1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TxlnbQ8VBT1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TxlnbQ8VBT1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TxlnbQ8VBT1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TxlnbQ8VBT1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TxlnbQ8VBT1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TxlnbQ8VBT1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TxlnbQ8VBT1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TxlnbQ8VBT1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TxlnbQ8VBT1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TxlnbQ8VBT1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TxlnbQ8VBT1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TxlnbQ8VBT1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TxlnbQ8VBT1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TxlnbQ8VBT1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TxlnbQ8VBT1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms