Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
OptnQ8K3K8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
OptnQ8K3K8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
OptnQ8K3K8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
OptnQ8K3K8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
OptnQ8K3K8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
OptnQ8K3K8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
OptnQ8K3K8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
OptnQ8K3K8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
OptnQ8K3K8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
OptnQ8K3K8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
OptnQ8K3K8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
OptnQ8K3K8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
OptnQ8K3K8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
OptnQ8K3K8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
OptnQ8K3K8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
OptnQ8K3K8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
OptnQ8K3K8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
OptnQ8K3K8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
OptnQ8K3K8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
OptnQ8K3K8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
OptnQ8K3K8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
OptnQ8K3K8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
OptnQ8K3K8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
OptnQ8K3K8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
OptnQ8K3K8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
OptnQ8K3K8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
OptnQ8K3K8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
OptnQ8K3K8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
OptnQ8K3K8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
OptnQ8K3K8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
OptnQ8K3K8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
OptnQ8K3K8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
OptnQ8K3K8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
OptnQ8K3K8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
OptnQ8K3K8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
OptnQ8K3K8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
OptnQ8K3K8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
OptnQ8K3K8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
OptnQ8K3K8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
OptnQ8K3K8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
OptnQ8K3K8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
OptnQ8K3K8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
OptnQ8K3K8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
OptnQ8K3K8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
OptnQ8K3K8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
OptnQ8K3K8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
OptnQ8K3K8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
OptnQ8K3K8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
OptnQ8K3K8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
OptnQ8K3K8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
OptnQ8K3K8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
OptnQ8K3K8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
OptnQ8K3K8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
OptnQ8K3K8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
OptnQ8K3K8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
OptnQ8K3K8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
OptnQ8K3K8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
OptnQ8K3K8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
OptnQ8K3K8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
OptnQ8K3K8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
OptnQ8K3K8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
OptnQ8K3K8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
OptnQ8K3K8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
OptnQ8K3K8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
OptnQ8K3K8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
OptnQ8K3K8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
OptnQ8K3K8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
OptnQ8K3K8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
OptnQ8K3K8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
OptnQ8K3K8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
OptnQ8K3K8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
OptnQ8K3K8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
OptnQ8K3K8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
OptnQ8K3K8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
OptnQ8K3K8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
OptnQ8K3K8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
OptnQ8K3K8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
OptnQ8K3K8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
OptnQ8K3K8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
OptnQ8K3K8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
OptnQ8K3K8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
OptnQ8K3K8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
OptnQ8K3K8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
OptnQ8K3K8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
OptnQ8K3K8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
OptnQ8K3K8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
OptnQ8K3K8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
OptnQ8K3K8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
OptnQ8K3K8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
OptnQ8K3K8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
OptnQ8K3K8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
OptnQ8K3K8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
OptnQ8K3K8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
OptnQ8K3K8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
OptnQ8K3K8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
OptnQ8K3K8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
OptnQ8K3K8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
OptnQ8K3K8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
OptnQ8K3K8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms