Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmbrd1Q8K0B2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmbrd1Q8K0B2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmbrd1Q8K0B2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmbrd1Q8K0B2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lmbrd1Q8K0B2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmbrd1Q8K0B2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmbrd1Q8K0B2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmbrd1Q8K0B2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmbrd1Q8K0B2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmbrd1Q8K0B2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmbrd1Q8K0B2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmbrd1Q8K0B2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmbrd1Q8K0B2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmbrd1Q8K0B2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lmbrd1Q8K0B2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmbrd1Q8K0B2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmbrd1Q8K0B2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmbrd1Q8K0B2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lmbrd1Q8K0B2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmbrd1Q8K0B2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmbrd1Q8K0B2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmbrd1Q8K0B2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lmbrd1Q8K0B2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmbrd1Q8K0B2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lmbrd1Q8K0B2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmbrd1Q8K0B2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmbrd1Q8K0B2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmbrd1Q8K0B2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmbrd1Q8K0B2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmbrd1Q8K0B2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmbrd1Q8K0B2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lmbrd1Q8K0B2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmbrd1Q8K0B2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmbrd1Q8K0B2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmbrd1Q8K0B2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmbrd1Q8K0B2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmbrd1Q8K0B2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lmbrd1Q8K0B2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lmbrd1Q8K0B2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lmbrd1Q8K0B2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmbrd1Q8K0B2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmbrd1Q8K0B2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmbrd1Q8K0B2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmbrd1Q8K0B2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmbrd1Q8K0B2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmbrd1Q8K0B2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmbrd1Q8K0B2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmbrd1Q8K0B2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmbrd1Q8K0B2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmbrd1Q8K0B2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmbrd1Q8K0B2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmbrd1Q8K0B2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmbrd1Q8K0B2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmbrd1Q8K0B2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmbrd1Q8K0B2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmbrd1Q8K0B2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmbrd1Q8K0B2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmbrd1Q8K0B2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmbrd1Q8K0B2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmbrd1Q8K0B2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmbrd1Q8K0B2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmbrd1Q8K0B2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmbrd1Q8K0B2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmbrd1Q8K0B2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmbrd1Q8K0B2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmbrd1Q8K0B2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmbrd1Q8K0B2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmbrd1Q8K0B2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmbrd1Q8K0B2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmbrd1Q8K0B2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmbrd1Q8K0B2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmbrd1Q8K0B2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmbrd1Q8K0B2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmbrd1Q8K0B2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmbrd1Q8K0B2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmbrd1Q8K0B2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmbrd1Q8K0B2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmbrd1Q8K0B2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmbrd1Q8K0B2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmbrd1Q8K0B2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmbrd1Q8K0B2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmbrd1Q8K0B2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmbrd1Q8K0B2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmbrd1Q8K0B2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmbrd1Q8K0B2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmbrd1Q8K0B2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmbrd1Q8K0B2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmbrd1Q8K0B2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmbrd1Q8K0B2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmbrd1Q8K0B2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmbrd1Q8K0B2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmbrd1Q8K0B2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmbrd1Q8K0B2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmbrd1Q8K0B2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmbrd1Q8K0B2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmbrd1Q8K0B2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms