Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lrit1Q8K099 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lrit1Q8K099 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Lrit1Q8K099 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lrit1Q8K099 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lrit1Q8K099 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lrit1Q8K099 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lrit1Q8K099 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrit1Q8K099 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrit1Q8K099 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrit1Q8K099 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrit1Q8K099 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrit1Q8K099 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrit1Q8K099 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lrit1Q8K099 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lrit1Q8K099 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lrit1Q8K099 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Lrit1Q8K099 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lrit1Q8K099 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lrit1Q8K099 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lrit1Q8K099 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lrit1Q8K099 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Lrit1Q8K099 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrit1Q8K099 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrit1Q8K099 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrit1Q8K099 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrit1Q8K099 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrit1Q8K099 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lrit1Q8K099 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lrit1Q8K099 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Lrit1Q8K099 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Lrit1Q8K099 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lrit1Q8K099 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lrit1Q8K099 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lrit1Q8K099 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Lrit1Q8K099 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lrit1Q8K099 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lrit1Q8K099 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lrit1Q8K099 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lrit1Q8K099 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lrit1Q8K099 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lrit1Q8K099 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lrit1Q8K099 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Lrit1Q8K099 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lrit1Q8K099 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lrit1Q8K099 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lrit1Q8K099 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lrit1Q8K099 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lrit1Q8K099 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrit1Q8K099 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrit1Q8K099 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrit1Q8K099 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrit1Q8K099 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrit1Q8K099 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrit1Q8K099 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrit1Q8K099 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrit1Q8K099 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lrit1Q8K099 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lrit1Q8K099 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lrit1Q8K099 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lrit1Q8K099 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrit1Q8K099 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrit1Q8K099 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrit1Q8K099 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrit1Q8K099 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrit1Q8K099 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrit1Q8K099 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lrit1Q8K099 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lrit1Q8K099 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lrit1Q8K099 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lrit1Q8K099 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lrit1Q8K099 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lrit1Q8K099 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lrit1Q8K099 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lrit1Q8K099 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lrit1Q8K099 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lrit1Q8K099 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lrit1Q8K099 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lrit1Q8K099 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lrit1Q8K099 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lrit1Q8K099 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lrit1Q8K099 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lrit1Q8K099 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lrit1Q8K099 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lrit1Q8K099 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Lrit1Q8K099 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lrit1Q8K099 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Lrit1Q8K099 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Lrit1Q8K099 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Lrit1Q8K099 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lrit1Q8K099 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lrit1Q8K099 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lrit1Q8K099 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Lrit1Q8K099 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lrit1Q8K099 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lrit1Q8K099 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lrit1Q8K099 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lrit1Q8K099 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lrit1Q8K099 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lrit1Q8K099 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms