Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LgsnQ8CIX8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LgsnQ8CIX8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LgsnQ8CIX8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LgsnQ8CIX8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LgsnQ8CIX8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LgsnQ8CIX8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LgsnQ8CIX8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LgsnQ8CIX8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LgsnQ8CIX8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LgsnQ8CIX8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LgsnQ8CIX8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LgsnQ8CIX8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LgsnQ8CIX8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LgsnQ8CIX8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LgsnQ8CIX8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LgsnQ8CIX8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LgsnQ8CIX8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LgsnQ8CIX8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LgsnQ8CIX8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LgsnQ8CIX8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LgsnQ8CIX8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LgsnQ8CIX8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LgsnQ8CIX8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LgsnQ8CIX8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LgsnQ8CIX8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LgsnQ8CIX8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LgsnQ8CIX8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LgsnQ8CIX8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LgsnQ8CIX8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LgsnQ8CIX8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LgsnQ8CIX8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LgsnQ8CIX8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LgsnQ8CIX8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LgsnQ8CIX8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LgsnQ8CIX8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LgsnQ8CIX8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LgsnQ8CIX8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LgsnQ8CIX8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LgsnQ8CIX8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LgsnQ8CIX8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LgsnQ8CIX8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LgsnQ8CIX8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LgsnQ8CIX8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LgsnQ8CIX8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LgsnQ8CIX8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LgsnQ8CIX8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LgsnQ8CIX8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LgsnQ8CIX8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LgsnQ8CIX8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LgsnQ8CIX8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LgsnQ8CIX8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LgsnQ8CIX8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LgsnQ8CIX8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LgsnQ8CIX8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LgsnQ8CIX8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LgsnQ8CIX8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LgsnQ8CIX8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LgsnQ8CIX8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LgsnQ8CIX8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LgsnQ8CIX8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LgsnQ8CIX8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LgsnQ8CIX8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LgsnQ8CIX8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LgsnQ8CIX8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LgsnQ8CIX8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LgsnQ8CIX8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LgsnQ8CIX8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LgsnQ8CIX8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LgsnQ8CIX8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LgsnQ8CIX8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LgsnQ8CIX8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LgsnQ8CIX8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LgsnQ8CIX8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LgsnQ8CIX8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LgsnQ8CIX8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LgsnQ8CIX8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LgsnQ8CIX8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LgsnQ8CIX8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LgsnQ8CIX8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LgsnQ8CIX8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LgsnQ8CIX8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LgsnQ8CIX8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LgsnQ8CIX8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LgsnQ8CIX8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LgsnQ8CIX8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LgsnQ8CIX8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LgsnQ8CIX8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LgsnQ8CIX8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LgsnQ8CIX8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LgsnQ8CIX8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LgsnQ8CIX8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LgsnQ8CIX8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LgsnQ8CIX8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LgsnQ8CIX8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LgsnQ8CIX8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LgsnQ8CIX8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LgsnQ8CIX8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LgsnQ8CIX8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LgsnQ8CIX8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms