Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc63Q8CDV6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc63Q8CDV6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc63Q8CDV6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc63Q8CDV6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc63Q8CDV6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc63Q8CDV6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc63Q8CDV6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc63Q8CDV6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc63Q8CDV6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc63Q8CDV6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc63Q8CDV6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc63Q8CDV6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc63Q8CDV6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc63Q8CDV6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc63Q8CDV6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc63Q8CDV6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc63Q8CDV6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc63Q8CDV6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc63Q8CDV6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc63Q8CDV6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc63Q8CDV6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc63Q8CDV6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc63Q8CDV6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc63Q8CDV6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc63Q8CDV6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc63Q8CDV6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc63Q8CDV6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc63Q8CDV6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc63Q8CDV6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc63Q8CDV6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc63Q8CDV6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc63Q8CDV6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc63Q8CDV6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc63Q8CDV6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc63Q8CDV6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc63Q8CDV6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc63Q8CDV6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc63Q8CDV6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc63Q8CDV6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc63Q8CDV6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc63Q8CDV6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc63Q8CDV6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.7 ms