Protein–RNA interactions for Protein: Q8C878

Uba3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba3Q8C878 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Uba3Q8C878 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Uba3Q8C878 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Uba3Q8C878 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uba3Q8C878 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uba3Q8C878 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uba3Q8C878 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uba3Q8C878 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uba3Q8C878 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uba3Q8C878 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uba3Q8C878 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uba3Q8C878 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uba3Q8C878 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uba3Q8C878 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uba3Q8C878 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uba3Q8C878 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Uba3Q8C878 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uba3Q8C878 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uba3Q8C878 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uba3Q8C878 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uba3Q8C878 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Uba3Q8C878 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Uba3Q8C878 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Uba3Q8C878 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Uba3Q8C878 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Uba3Q8C878 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Uba3Q8C878 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Uba3Q8C878 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Uba3Q8C878 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Uba3Q8C878 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Uba3Q8C878 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Uba3Q8C878 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Uba3Q8C878 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Uba3Q8C878 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uba3Q8C878 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uba3Q8C878 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uba3Q8C878 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uba3Q8C878 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uba3Q8C878 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Uba3Q8C878 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uba3Q8C878 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uba3Q8C878 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uba3Q8C878 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uba3Q8C878 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Uba3Q8C878 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uba3Q8C878 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uba3Q8C878 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uba3Q8C878 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uba3Q8C878 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uba3Q8C878 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uba3Q8C878 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Uba3Q8C878 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uba3Q8C878 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uba3Q8C878 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uba3Q8C878 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Uba3Q8C878 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uba3Q8C878 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uba3Q8C878 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uba3Q8C878 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Uba3Q8C878 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms