Protein–RNA interactions for Protein: Q8BS39

Ccdc32, Coiled-coil domain-containing protein 32, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc32Q8BS39 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc32Q8BS39 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc32Q8BS39 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc32Q8BS39 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc32Q8BS39 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc32Q8BS39 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc32Q8BS39 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc32Q8BS39 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc32Q8BS39 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc32Q8BS39 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc32Q8BS39 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc32Q8BS39 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc32Q8BS39 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc32Q8BS39 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc32Q8BS39 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc32Q8BS39 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc32Q8BS39 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc32Q8BS39 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc32Q8BS39 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc32Q8BS39 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc32Q8BS39 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc32Q8BS39 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc32Q8BS39 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc32Q8BS39 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc32Q8BS39 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc32Q8BS39 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc32Q8BS39 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc32Q8BS39 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc32Q8BS39 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc32Q8BS39 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc32Q8BS39 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc32Q8BS39 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc32Q8BS39 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc32Q8BS39 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc32Q8BS39 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc32Q8BS39 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc32Q8BS39 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc32Q8BS39 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc32Q8BS39 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc32Q8BS39 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc32Q8BS39 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc32Q8BS39 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc32Q8BS39 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc32Q8BS39 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc32Q8BS39 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc32Q8BS39 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc32Q8BS39 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc32Q8BS39 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc32Q8BS39 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc32Q8BS39 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc32Q8BS39 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc32Q8BS39 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc32Q8BS39 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc32Q8BS39 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc32Q8BS39 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc32Q8BS39 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc32Q8BS39 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc32Q8BS39 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms