Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarcal1Q8BJL0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarcal1Q8BJL0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarcal1Q8BJL0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarcal1Q8BJL0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarcal1Q8BJL0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarcal1Q8BJL0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarcal1Q8BJL0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarcal1Q8BJL0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarcal1Q8BJL0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarcal1Q8BJL0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarcal1Q8BJL0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarcal1Q8BJL0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarcal1Q8BJL0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarcal1Q8BJL0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarcal1Q8BJL0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarcal1Q8BJL0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarcal1Q8BJL0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarcal1Q8BJL0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarcal1Q8BJL0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarcal1Q8BJL0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarcal1Q8BJL0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarcal1Q8BJL0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarcal1Q8BJL0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarcal1Q8BJL0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarcal1Q8BJL0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarcal1Q8BJL0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarcal1Q8BJL0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarcal1Q8BJL0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarcal1Q8BJL0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarcal1Q8BJL0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarcal1Q8BJL0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarcal1Q8BJL0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarcal1Q8BJL0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarcal1Q8BJL0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarcal1Q8BJL0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarcal1Q8BJL0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarcal1Q8BJL0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarcal1Q8BJL0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarcal1Q8BJL0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarcal1Q8BJL0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarcal1Q8BJL0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarcal1Q8BJL0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarcal1Q8BJL0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarcal1Q8BJL0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarcal1Q8BJL0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarcal1Q8BJL0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarcal1Q8BJL0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarcal1Q8BJL0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarcal1Q8BJL0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarcal1Q8BJL0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarcal1Q8BJL0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarcal1Q8BJL0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarcal1Q8BJL0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarcal1Q8BJL0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarcal1Q8BJL0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarcal1Q8BJL0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarcal1Q8BJL0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarcal1Q8BJL0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarcal1Q8BJL0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smarcal1Q8BJL0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Smarcal1Q8BJL0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarcal1Q8BJL0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarcal1Q8BJL0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarcal1Q8BJL0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarcal1Q8BJL0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarcal1Q8BJL0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarcal1Q8BJL0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarcal1Q8BJL0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarcal1Q8BJL0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarcal1Q8BJL0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarcal1Q8BJL0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarcal1Q8BJL0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarcal1Q8BJL0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarcal1Q8BJL0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarcal1Q8BJL0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarcal1Q8BJL0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarcal1Q8BJL0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarcal1Q8BJL0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarcal1Q8BJL0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarcal1Q8BJL0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarcal1Q8BJL0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarcal1Q8BJL0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarcal1Q8BJL0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarcal1Q8BJL0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smarcal1Q8BJL0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smarcal1Q8BJL0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms