Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Kdm5bQ80Y84 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC34,18■■■■□ 3,06
Kdm5bQ80Y84 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC34,18■■■■□ 3,06
Kdm5bQ80Y84 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Kdm5bQ80Y84 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC34,17■■■■□ 3,06
Kdm5bQ80Y84 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC34,17■■■■□ 3,06
Kdm5bQ80Y84 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC34,15■■■■□ 3,06
Kdm5bQ80Y84 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34,14■■■■□ 3,06
Kdm5bQ80Y84 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Kdm5bQ80Y84 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC34,14■■■■□ 3,06
Kdm5bQ80Y84 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,14■■■■□ 3,06
Kdm5bQ80Y84 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Kdm5bQ80Y84 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Kdm5bQ80Y84 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Kdm5bQ80Y84 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC34,13■■■■□ 3,05
Kdm5bQ80Y84 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC34,13■■■■□ 3,05
Kdm5bQ80Y84 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,12■■■■□ 3,05
Kdm5bQ80Y84 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,12■■■■□ 3,05
Kdm5bQ80Y84 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,11■■■■□ 3,05
Kdm5bQ80Y84 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC34,1■■■■□ 3,05
Kdm5bQ80Y84 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Kdm5bQ80Y84 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Kdm5bQ80Y84 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Kdm5bQ80Y84 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Kdm5bQ80Y84 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Kdm5bQ80Y84 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Kdm5bQ80Y84 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Kdm5bQ80Y84 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Kdm5bQ80Y84 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34,08■■■■□ 3,05
Kdm5bQ80Y84 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Kdm5bQ80Y84 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Kdm5bQ80Y84 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Kdm5bQ80Y84 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,07■■■■□ 3,05
Kdm5bQ80Y84 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Kdm5bQ80Y84 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC34,07■■■■□ 3,04
Kdm5bQ80Y84 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
Kdm5bQ80Y84 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Kdm5bQ80Y84 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Kdm5bQ80Y84 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Kdm5bQ80Y84 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Kdm5bQ80Y84 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
Kdm5bQ80Y84 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Kdm5bQ80Y84 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC34,04■■■■□ 3,04
Kdm5bQ80Y84 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC34,04■■■■□ 3,04
Kdm5bQ80Y84 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Kdm5bQ80Y84 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
Kdm5bQ80Y84 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC34,04■■■■□ 3,04
Kdm5bQ80Y84 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Kdm5bQ80Y84 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC34,03■■■■□ 3,04
Kdm5bQ80Y84 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Kdm5bQ80Y84 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Kdm5bQ80Y84 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,02■■■■□ 3,04
Kdm5bQ80Y84 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
Kdm5bQ80Y84 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34,02■■■■□ 3,04
Kdm5bQ80Y84 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,04
Kdm5bQ80Y84 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3,03
Kdm5bQ80Y84 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
Kdm5bQ80Y84 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
Kdm5bQ80Y84 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
Kdm5bQ80Y84 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
Kdm5bQ80Y84 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Kdm5bQ80Y84 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Kdm5bQ80Y84 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC33,99■■■■□ 3,03
Kdm5bQ80Y84 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC33,99■■■■□ 3,03
Kdm5bQ80Y84 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC33,99■■■■□ 3,03
Kdm5bQ80Y84 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Kdm5bQ80Y84 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC33,98■■■■□ 3,03
Kdm5bQ80Y84 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC33,98■■■■□ 3,03
Kdm5bQ80Y84 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Kdm5bQ80Y84 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Kdm5bQ80Y84 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Kdm5bQ80Y84 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Kdm5bQ80Y84 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,97■■■■□ 3,03
Kdm5bQ80Y84 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC33,96■■■■□ 3,03
Kdm5bQ80Y84 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
Kdm5bQ80Y84 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC33,96■■■■□ 3,03
Kdm5bQ80Y84 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC33,96■■■■□ 3,03
Kdm5bQ80Y84 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC33,96■■■■□ 3,03
Kdm5bQ80Y84 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
Kdm5bQ80Y84 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
Kdm5bQ80Y84 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
Kdm5bQ80Y84 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
Kdm5bQ80Y84 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
Kdm5bQ80Y84 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC33,95■■■■□ 3,03
Kdm5bQ80Y84 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,95■■■■□ 3,02
Kdm5bQ80Y84 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC33,94■■■■□ 3,02
Kdm5bQ80Y84 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Kdm5bQ80Y84 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC33,93■■■■□ 3,02
Kdm5bQ80Y84 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Kdm5bQ80Y84 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,93■■■■□ 3,02
Kdm5bQ80Y84 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC33,93■■■■□ 3,02
Kdm5bQ80Y84 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Kdm5bQ80Y84 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Kdm5bQ80Y84 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
Kdm5bQ80Y84 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC33,91■■■■□ 3,02
Kdm5bQ80Y84 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC33,91■■■■□ 3,02
Kdm5bQ80Y84 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC33,9■■■■□ 3,02
Kdm5bQ80Y84 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC33,9■■■■□ 3,02
Kdm5bQ80Y84 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC33,9■■■■□ 3,02
Kdm5bQ80Y84 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17,4 ms