Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT37

Elp1, Elongator complex protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp1Q7TT37 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Elp1Q7TT37 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Elp1Q7TT37 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Elp1Q7TT37 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Elp1Q7TT37 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Elp1Q7TT37 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Elp1Q7TT37 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Elp1Q7TT37 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Elp1Q7TT37 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Elp1Q7TT37 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Elp1Q7TT37 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Elp1Q7TT37 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Elp1Q7TT37 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Elp1Q7TT37 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Elp1Q7TT37 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Elp1Q7TT37 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Elp1Q7TT37 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Elp1Q7TT37 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Elp1Q7TT37 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Elp1Q7TT37 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Elp1Q7TT37 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Elp1Q7TT37 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Elp1Q7TT37 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Elp1Q7TT37 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Elp1Q7TT37 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Elp1Q7TT37 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Elp1Q7TT37 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Elp1Q7TT37 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Elp1Q7TT37 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Elp1Q7TT37 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Elp1Q7TT37 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Elp1Q7TT37 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Elp1Q7TT37 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Elp1Q7TT37 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Elp1Q7TT37 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Elp1Q7TT37 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Elp1Q7TT37 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Elp1Q7TT37 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Elp1Q7TT37 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Elp1Q7TT37 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Elp1Q7TT37 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Elp1Q7TT37 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Elp1Q7TT37 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Elp1Q7TT37 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Elp1Q7TT37 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Elp1Q7TT37 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Elp1Q7TT37 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Elp1Q7TT37 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Elp1Q7TT37 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Elp1Q7TT37 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Elp1Q7TT37 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Elp1Q7TT37 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Elp1Q7TT37 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Elp1Q7TT37 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Elp1Q7TT37 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Elp1Q7TT37 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Elp1Q7TT37 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Elp1Q7TT37 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Elp1Q7TT37 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Elp1Q7TT37 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Elp1Q7TT37 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Elp1Q7TT37 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Elp1Q7TT37 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Elp1Q7TT37 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Elp1Q7TT37 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Elp1Q7TT37 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Elp1Q7TT37 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Elp1Q7TT37 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Elp1Q7TT37 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Elp1Q7TT37 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Elp1Q7TT37 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Elp1Q7TT37 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Elp1Q7TT37 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Elp1Q7TT37 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Elp1Q7TT37 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Elp1Q7TT37 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Elp1Q7TT37 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Elp1Q7TT37 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Elp1Q7TT37 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Elp1Q7TT37 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Elp1Q7TT37 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Elp1Q7TT37 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Elp1Q7TT37 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Elp1Q7TT37 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Elp1Q7TT37 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Elp1Q7TT37 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Elp1Q7TT37 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Elp1Q7TT37 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Elp1Q7TT37 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Elp1Q7TT37 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Elp1Q7TT37 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Elp1Q7TT37 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Elp1Q7TT37 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Elp1Q7TT37 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Elp1Q7TT37 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Elp1Q7TT37 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Elp1Q7TT37 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Elp1Q7TT37 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Elp1Q7TT37 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Elp1Q7TT37 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms