Protein–RNA interactions for Protein: Q78JE5

Fbxo22, F-box only protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo22Q78JE5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo22Q78JE5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo22Q78JE5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo22Q78JE5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo22Q78JE5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fbxo22Q78JE5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fbxo22Q78JE5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fbxo22Q78JE5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fbxo22Q78JE5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo22Q78JE5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo22Q78JE5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo22Q78JE5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo22Q78JE5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo22Q78JE5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fbxo22Q78JE5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo22Q78JE5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo22Q78JE5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fbxo22Q78JE5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo22Q78JE5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo22Q78JE5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo22Q78JE5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo22Q78JE5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo22Q78JE5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo22Q78JE5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Fbxo22Q78JE5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo22Q78JE5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo22Q78JE5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo22Q78JE5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo22Q78JE5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo22Q78JE5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo22Q78JE5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fbxo22Q78JE5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo22Q78JE5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo22Q78JE5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo22Q78JE5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo22Q78JE5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo22Q78JE5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo22Q78JE5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo22Q78JE5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo22Q78JE5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fbxo22Q78JE5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo22Q78JE5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo22Q78JE5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo22Q78JE5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fbxo22Q78JE5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo22Q78JE5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo22Q78JE5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo22Q78JE5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo22Q78JE5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo22Q78JE5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fbxo22Q78JE5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxo22Q78JE5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxo22Q78JE5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxo22Q78JE5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxo22Q78JE5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxo22Q78JE5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxo22Q78JE5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxo22Q78JE5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fbxo22Q78JE5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms