Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpl35Q6ZWV7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpl35Q6ZWV7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpl35Q6ZWV7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpl35Q6ZWV7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpl35Q6ZWV7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpl35Q6ZWV7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpl35Q6ZWV7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpl35Q6ZWV7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpl35Q6ZWV7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpl35Q6ZWV7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpl35Q6ZWV7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl35Q6ZWV7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl35Q6ZWV7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl35Q6ZWV7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl35Q6ZWV7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl35Q6ZWV7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpl35Q6ZWV7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpl35Q6ZWV7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl35Q6ZWV7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl35Q6ZWV7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl35Q6ZWV7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl35Q6ZWV7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl35Q6ZWV7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl35Q6ZWV7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl35Q6ZWV7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpl35Q6ZWV7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpl35Q6ZWV7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpl35Q6ZWV7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpl35Q6ZWV7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpl35Q6ZWV7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpl35Q6ZWV7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpl35Q6ZWV7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpl35Q6ZWV7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpl35Q6ZWV7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpl35Q6ZWV7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpl35Q6ZWV7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpl35Q6ZWV7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpl35Q6ZWV7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpl35Q6ZWV7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpl35Q6ZWV7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpl35Q6ZWV7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpl35Q6ZWV7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpl35Q6ZWV7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpl35Q6ZWV7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpl35Q6ZWV7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpl35Q6ZWV7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms