Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nup188Q6ZQH8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nup188Q6ZQH8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nup188Q6ZQH8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nup188Q6ZQH8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nup188Q6ZQH8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nup188Q6ZQH8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Nup188Q6ZQH8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nup188Q6ZQH8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nup188Q6ZQH8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nup188Q6ZQH8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Nup188Q6ZQH8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nup188Q6ZQH8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nup188Q6ZQH8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Nup188Q6ZQH8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nup188Q6ZQH8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nup188Q6ZQH8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nup188Q6ZQH8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nup188Q6ZQH8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nup188Q6ZQH8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nup188Q6ZQH8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nup188Q6ZQH8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nup188Q6ZQH8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nup188Q6ZQH8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nup188Q6ZQH8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nup188Q6ZQH8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nup188Q6ZQH8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nup188Q6ZQH8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nup188Q6ZQH8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nup188Q6ZQH8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nup188Q6ZQH8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nup188Q6ZQH8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nup188Q6ZQH8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nup188Q6ZQH8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Nup188Q6ZQH8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Nup188Q6ZQH8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nup188Q6ZQH8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Nup188Q6ZQH8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nup188Q6ZQH8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nup188Q6ZQH8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nup188Q6ZQH8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nup188Q6ZQH8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nup188Q6ZQH8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nup188Q6ZQH8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nup188Q6ZQH8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Nup188Q6ZQH8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nup188Q6ZQH8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nup188Q6ZQH8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nup188Q6ZQH8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nup188Q6ZQH8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nup188Q6ZQH8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nup188Q6ZQH8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nup188Q6ZQH8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nup188Q6ZQH8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nup188Q6ZQH8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nup188Q6ZQH8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nup188Q6ZQH8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nup188Q6ZQH8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nup188Q6ZQH8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nup188Q6ZQH8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nup188Q6ZQH8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nup188Q6ZQH8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nup188Q6ZQH8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nup188Q6ZQH8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nup188Q6ZQH8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nup188Q6ZQH8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nup188Q6ZQH8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nup188Q6ZQH8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nup188Q6ZQH8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nup188Q6ZQH8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nup188Q6ZQH8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nup188Q6ZQH8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Nup188Q6ZQH8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nup188Q6ZQH8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nup188Q6ZQH8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Nup188Q6ZQH8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nup188Q6ZQH8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nup188Q6ZQH8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nup188Q6ZQH8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nup188Q6ZQH8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nup188Q6ZQH8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nup188Q6ZQH8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Nup188Q6ZQH8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nup188Q6ZQH8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nup188Q6ZQH8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Nup188Q6ZQH8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nup188Q6ZQH8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nup188Q6ZQH8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nup188Q6ZQH8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Nup188Q6ZQH8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nup188Q6ZQH8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nup188Q6ZQH8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Nup188Q6ZQH8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nup188Q6ZQH8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nup188Q6ZQH8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nup188Q6ZQH8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nup188Q6ZQH8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nup188Q6ZQH8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nup188Q6ZQH8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nup188Q6ZQH8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms