Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Timd4Q6U7R4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Timd4Q6U7R4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Timd4Q6U7R4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Timd4Q6U7R4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Timd4Q6U7R4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Timd4Q6U7R4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Timd4Q6U7R4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Timd4Q6U7R4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Timd4Q6U7R4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Timd4Q6U7R4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Timd4Q6U7R4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Timd4Q6U7R4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Timd4Q6U7R4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Timd4Q6U7R4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Timd4Q6U7R4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Timd4Q6U7R4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Timd4Q6U7R4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Timd4Q6U7R4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Timd4Q6U7R4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Timd4Q6U7R4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Timd4Q6U7R4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Timd4Q6U7R4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Timd4Q6U7R4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Timd4Q6U7R4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Timd4Q6U7R4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Timd4Q6U7R4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Timd4Q6U7R4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Timd4Q6U7R4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Timd4Q6U7R4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Timd4Q6U7R4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Timd4Q6U7R4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Timd4Q6U7R4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Timd4Q6U7R4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Timd4Q6U7R4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Timd4Q6U7R4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Timd4Q6U7R4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Timd4Q6U7R4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Timd4Q6U7R4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Timd4Q6U7R4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Timd4Q6U7R4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Timd4Q6U7R4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Timd4Q6U7R4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Timd4Q6U7R4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Timd4Q6U7R4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Timd4Q6U7R4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Timd4Q6U7R4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Timd4Q6U7R4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Timd4Q6U7R4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Timd4Q6U7R4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Timd4Q6U7R4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Timd4Q6U7R4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Timd4Q6U7R4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Timd4Q6U7R4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Timd4Q6U7R4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Timd4Q6U7R4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Timd4Q6U7R4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Timd4Q6U7R4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Timd4Q6U7R4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Timd4Q6U7R4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Timd4Q6U7R4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Timd4Q6U7R4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Timd4Q6U7R4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Timd4Q6U7R4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Timd4Q6U7R4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Timd4Q6U7R4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Timd4Q6U7R4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Timd4Q6U7R4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Timd4Q6U7R4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Timd4Q6U7R4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Timd4Q6U7R4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Timd4Q6U7R4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Timd4Q6U7R4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Timd4Q6U7R4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Timd4Q6U7R4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Timd4Q6U7R4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Timd4Q6U7R4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Timd4Q6U7R4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Timd4Q6U7R4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Timd4Q6U7R4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Timd4Q6U7R4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Timd4Q6U7R4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Timd4Q6U7R4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms