Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cep170Q6A065 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cep170Q6A065 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cep170Q6A065 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Cep170Q6A065 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Cep170Q6A065 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Cep170Q6A065 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Cep170Q6A065 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Cep170Q6A065 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Cep170Q6A065 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Cep170Q6A065 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Cep170Q6A065 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Cep170Q6A065 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Cep170Q6A065 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Cep170Q6A065 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Cep170Q6A065 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Cep170Q6A065 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Cep170Q6A065 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Cep170Q6A065 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Cep170Q6A065 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Cep170Q6A065 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cep170Q6A065 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cep170Q6A065 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cep170Q6A065 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Cep170Q6A065 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Cep170Q6A065 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Cep170Q6A065 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Cep170Q6A065 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cep170Q6A065 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cep170Q6A065 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cep170Q6A065 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cep170Q6A065 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Cep170Q6A065 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cep170Q6A065 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cep170Q6A065 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Cep170Q6A065 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cep170Q6A065 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cep170Q6A065 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cep170Q6A065 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cep170Q6A065 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Cep170Q6A065 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Cep170Q6A065 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Cep170Q6A065 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Cep170Q6A065 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Cep170Q6A065 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Cep170Q6A065 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Cep170Q6A065 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Cep170Q6A065 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Cep170Q6A065 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Cep170Q6A065 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Cep170Q6A065 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Cep170Q6A065 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Cep170Q6A065 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Cep170Q6A065 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Cep170Q6A065 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Cep170Q6A065 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Cep170Q6A065 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Cep170Q6A065 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Cep170Q6A065 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Cep170Q6A065 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cep170Q6A065 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cep170Q6A065 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cep170Q6A065 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Cep170Q6A065 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cep170Q6A065 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cep170Q6A065 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Cep170Q6A065 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
Cep170Q6A065 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Cep170Q6A065 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Cep170Q6A065 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Cep170Q6A065 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Cep170Q6A065 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Cep170Q6A065 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Cep170Q6A065 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Cep170Q6A065 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Cep170Q6A065 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Cep170Q6A065 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Cep170Q6A065 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Cep170Q6A065 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Cep170Q6A065 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cep170Q6A065 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Cep170Q6A065 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Cep170Q6A065 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Cep170Q6A065 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cep170Q6A065 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Cep170Q6A065 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cep170Q6A065 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Cep170Q6A065 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cep170Q6A065 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cep170Q6A065 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Cep170Q6A065 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Cep170Q6A065 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Cep170Q6A065 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cep170Q6A065 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Cep170Q6A065 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cep170Q6A065 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cep170Q6A065 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Cep170Q6A065 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cep170Q6A065 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Cep170Q6A065 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms