Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ric1Q69ZJ7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ric1Q69ZJ7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ric1Q69ZJ7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ric1Q69ZJ7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ric1Q69ZJ7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ric1Q69ZJ7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ric1Q69ZJ7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ric1Q69ZJ7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Ric1Q69ZJ7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ric1Q69ZJ7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Ric1Q69ZJ7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ric1Q69ZJ7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ric1Q69ZJ7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Ric1Q69ZJ7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ric1Q69ZJ7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ric1Q69ZJ7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ric1Q69ZJ7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ric1Q69ZJ7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ric1Q69ZJ7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ric1Q69ZJ7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ric1Q69ZJ7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ric1Q69ZJ7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ric1Q69ZJ7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Ric1Q69ZJ7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ric1Q69ZJ7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ric1Q69ZJ7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ric1Q69ZJ7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ric1Q69ZJ7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ric1Q69ZJ7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ric1Q69ZJ7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ric1Q69ZJ7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ric1Q69ZJ7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ric1Q69ZJ7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ric1Q69ZJ7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ric1Q69ZJ7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ric1Q69ZJ7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ric1Q69ZJ7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ric1Q69ZJ7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ric1Q69ZJ7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ric1Q69ZJ7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ric1Q69ZJ7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ric1Q69ZJ7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ric1Q69ZJ7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ric1Q69ZJ7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ric1Q69ZJ7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ric1Q69ZJ7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ric1Q69ZJ7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ric1Q69ZJ7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ric1Q69ZJ7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ric1Q69ZJ7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ric1Q69ZJ7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ric1Q69ZJ7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ric1Q69ZJ7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ric1Q69ZJ7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ric1Q69ZJ7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ric1Q69ZJ7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ric1Q69ZJ7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ric1Q69ZJ7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ric1Q69ZJ7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ric1Q69ZJ7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ric1Q69ZJ7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ric1Q69ZJ7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ric1Q69ZJ7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ric1Q69ZJ7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ric1Q69ZJ7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ric1Q69ZJ7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ric1Q69ZJ7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ric1Q69ZJ7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ric1Q69ZJ7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ric1Q69ZJ7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ric1Q69ZJ7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ric1Q69ZJ7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ric1Q69ZJ7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ric1Q69ZJ7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ric1Q69ZJ7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ric1Q69ZJ7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ric1Q69ZJ7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ric1Q69ZJ7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ric1Q69ZJ7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ric1Q69ZJ7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ric1Q69ZJ7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ric1Q69ZJ7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ric1Q69ZJ7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.58■■■□□ 2
Ric1Q69ZJ7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Ric1Q69ZJ7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Ric1Q69ZJ7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Ric1Q69ZJ7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ric1Q69ZJ7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Ric1Q69ZJ7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ric1Q69ZJ7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ric1Q69ZJ7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ric1Q69ZJ7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ric1Q69ZJ7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ric1Q69ZJ7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ric1Q69ZJ7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ric1Q69ZJ7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ric1Q69ZJ7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ric1Q69ZJ7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ric1Q69ZJ7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms