Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrrc8eQ66JT1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lrrc8eQ66JT1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc8eQ66JT1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc8eQ66JT1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc8eQ66JT1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc8eQ66JT1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc8eQ66JT1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc8eQ66JT1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc8eQ66JT1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc8eQ66JT1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc8eQ66JT1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrrc8eQ66JT1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc8eQ66JT1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc8eQ66JT1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc8eQ66JT1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrrc8eQ66JT1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc8eQ66JT1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc8eQ66JT1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc8eQ66JT1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc8eQ66JT1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrrc8eQ66JT1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc8eQ66JT1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc8eQ66JT1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc8eQ66JT1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrrc8eQ66JT1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc8eQ66JT1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc8eQ66JT1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc8eQ66JT1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc8eQ66JT1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc8eQ66JT1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc8eQ66JT1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc8eQ66JT1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc8eQ66JT1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc8eQ66JT1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc8eQ66JT1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc8eQ66JT1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc8eQ66JT1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc8eQ66JT1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc8eQ66JT1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc8eQ66JT1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc8eQ66JT1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc8eQ66JT1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc8eQ66JT1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc8eQ66JT1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc8eQ66JT1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc8eQ66JT1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc8eQ66JT1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc8eQ66JT1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc8eQ66JT1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc8eQ66JT1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc8eQ66JT1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc8eQ66JT1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc8eQ66JT1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc8eQ66JT1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc8eQ66JT1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc8eQ66JT1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc8eQ66JT1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc8eQ66JT1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc8eQ66JT1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc8eQ66JT1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc8eQ66JT1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc8eQ66JT1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc8eQ66JT1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms