Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpd52Q62393 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpd52Q62393 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpd52Q62393 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpd52Q62393 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpd52Q62393 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpd52Q62393 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tpd52Q62393 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpd52Q62393 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpd52Q62393 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpd52Q62393 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpd52Q62393 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpd52Q62393 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpd52Q62393 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpd52Q62393 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpd52Q62393 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tpd52Q62393 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpd52Q62393 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpd52Q62393 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpd52Q62393 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpd52Q62393 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpd52Q62393 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tpd52Q62393 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpd52Q62393 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpd52Q62393 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpd52Q62393 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpd52Q62393 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tpd52Q62393 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tpd52Q62393 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tpd52Q62393 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tpd52Q62393 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tpd52Q62393 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tpd52Q62393 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tpd52Q62393 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tpd52Q62393 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tpd52Q62393 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tpd52Q62393 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tpd52Q62393 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tpd52Q62393 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tpd52Q62393 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tpd52Q62393 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tpd52Q62393 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tpd52Q62393 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tpd52Q62393 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tpd52Q62393 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tpd52Q62393 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tpd52Q62393 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpd52Q62393 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpd52Q62393 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpd52Q62393 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpd52Q62393 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpd52Q62393 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpd52Q62393 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpd52Q62393 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tpd52Q62393 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpd52Q62393 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpd52Q62393 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpd52Q62393 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpd52Q62393 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpd52Q62393 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tpd52Q62393 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpd52Q62393 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpd52Q62393 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpd52Q62393 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpd52Q62393 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tpd52Q62393 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpd52Q62393 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpd52Q62393 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tpd52Q62393 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpd52Q62393 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpd52Q62393 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpd52Q62393 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpd52Q62393 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tpd52Q62393 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tpd52Q62393 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tpd52Q62393 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tpd52Q62393 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tpd52Q62393 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tpd52Q62393 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tpd52Q62393 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpd52Q62393 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpd52Q62393 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpd52Q62393 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpd52Q62393 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tpd52Q62393 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpd52Q62393 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpd52Q62393 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpd52Q62393 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tpd52Q62393 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpd52Q62393 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpd52Q62393 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpd52Q62393 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tpd52Q62393 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpd52Q62393 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpd52Q62393 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpd52Q62393 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpd52Q62393 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tpd52Q62393 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpd52Q62393 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tpd52Q62393 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms