Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ttf1Q62187 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttf1Q62187 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ttf1Q62187 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttf1Q62187 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttf1Q62187 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttf1Q62187 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttf1Q62187 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ttf1Q62187 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttf1Q62187 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttf1Q62187 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttf1Q62187 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttf1Q62187 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ttf1Q62187 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttf1Q62187 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttf1Q62187 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttf1Q62187 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttf1Q62187 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttf1Q62187 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttf1Q62187 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttf1Q62187 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttf1Q62187 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttf1Q62187 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Ttf1Q62187 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttf1Q62187 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Ttf1Q62187 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttf1Q62187 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttf1Q62187 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttf1Q62187 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttf1Q62187 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Ttf1Q62187 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttf1Q62187 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Ttf1Q62187 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttf1Q62187 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttf1Q62187 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttf1Q62187 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttf1Q62187 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttf1Q62187 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttf1Q62187 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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Ttf1Q62187 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttf1Q62187 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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Ttf1Q62187 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttf1Q62187 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
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