Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nr2f1Q60632 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nr2f1Q60632 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nr2f1Q60632 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nr2f1Q60632 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nr2f1Q60632 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nr2f1Q60632 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nr2f1Q60632 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nr2f1Q60632 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nr2f1Q60632 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nr2f1Q60632 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nr2f1Q60632 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nr2f1Q60632 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nr2f1Q60632 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nr2f1Q60632 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nr2f1Q60632 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nr2f1Q60632 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nr2f1Q60632 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nr2f1Q60632 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nr2f1Q60632 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nr2f1Q60632 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nr2f1Q60632 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nr2f1Q60632 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nr2f1Q60632 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nr2f1Q60632 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nr2f1Q60632 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nr2f1Q60632 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nr2f1Q60632 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nr2f1Q60632 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nr2f1Q60632 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nr2f1Q60632 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nr2f1Q60632 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nr2f1Q60632 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nr2f1Q60632 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nr2f1Q60632 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nr2f1Q60632 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nr2f1Q60632 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nr2f1Q60632 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nr2f1Q60632 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nr2f1Q60632 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nr2f1Q60632 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 674.7 ms