Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW75

Ssh2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh2Q5SW75 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ssh2Q5SW75 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ssh2Q5SW75 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ssh2Q5SW75 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ssh2Q5SW75 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ssh2Q5SW75 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ssh2Q5SW75 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ssh2Q5SW75 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ssh2Q5SW75 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ssh2Q5SW75 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ssh2Q5SW75 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ssh2Q5SW75 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ssh2Q5SW75 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ssh2Q5SW75 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Ssh2Q5SW75 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ssh2Q5SW75 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ssh2Q5SW75 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Ssh2Q5SW75 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Ssh2Q5SW75 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ssh2Q5SW75 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Ssh2Q5SW75 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ssh2Q5SW75 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ssh2Q5SW75 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Ssh2Q5SW75 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ssh2Q5SW75 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ssh2Q5SW75 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ssh2Q5SW75 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Ssh2Q5SW75 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ssh2Q5SW75 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Ssh2Q5SW75 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ssh2Q5SW75 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ssh2Q5SW75 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ssh2Q5SW75 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ssh2Q5SW75 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ssh2Q5SW75 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ssh2Q5SW75 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ssh2Q5SW75 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ssh2Q5SW75 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Ssh2Q5SW75 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ssh2Q5SW75 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ssh2Q5SW75 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ssh2Q5SW75 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ssh2Q5SW75 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ssh2Q5SW75 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Ssh2Q5SW75 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Ssh2Q5SW75 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Ssh2Q5SW75 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Ssh2Q5SW75 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Ssh2Q5SW75 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Ssh2Q5SW75 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ssh2Q5SW75 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ssh2Q5SW75 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ssh2Q5SW75 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Ssh2Q5SW75 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ssh2Q5SW75 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ssh2Q5SW75 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ssh2Q5SW75 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ssh2Q5SW75 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ssh2Q5SW75 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Ssh2Q5SW75 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ssh2Q5SW75 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ssh2Q5SW75 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Ssh2Q5SW75 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Ssh2Q5SW75 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Ssh2Q5SW75 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Ssh2Q5SW75 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ssh2Q5SW75 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ssh2Q5SW75 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ssh2Q5SW75 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ssh2Q5SW75 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ssh2Q5SW75 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Ssh2Q5SW75 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Ssh2Q5SW75 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Ssh2Q5SW75 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Ssh2Q5SW75 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Ssh2Q5SW75 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ssh2Q5SW75 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ssh2Q5SW75 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ssh2Q5SW75 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ssh2Q5SW75 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ssh2Q5SW75 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ssh2Q5SW75 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ssh2Q5SW75 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ssh2Q5SW75 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ssh2Q5SW75 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ssh2Q5SW75 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ssh2Q5SW75 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ssh2Q5SW75 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ssh2Q5SW75 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ssh2Q5SW75 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ssh2Q5SW75 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Ssh2Q5SW75 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ssh2Q5SW75 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ssh2Q5SW75 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ssh2Q5SW75 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ssh2Q5SW75 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ssh2Q5SW75 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Ssh2Q5SW75 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ssh2Q5SW75 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ssh2Q5SW75 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms