Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc47Q505F5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc47Q505F5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc47Q505F5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc47Q505F5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc47Q505F5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrrc47Q505F5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc47Q505F5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc47Q505F5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc47Q505F5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc47Q505F5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrrc47Q505F5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc47Q505F5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc47Q505F5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc47Q505F5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc47Q505F5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc47Q505F5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc47Q505F5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc47Q505F5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc47Q505F5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc47Q505F5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc47Q505F5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc47Q505F5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc47Q505F5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc47Q505F5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc47Q505F5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc47Q505F5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc47Q505F5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc47Q505F5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc47Q505F5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc47Q505F5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc47Q505F5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc47Q505F5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc47Q505F5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc47Q505F5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc47Q505F5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc47Q505F5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc47Q505F5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc47Q505F5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc47Q505F5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc47Q505F5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc47Q505F5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc47Q505F5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc47Q505F5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc47Q505F5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc47Q505F5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc47Q505F5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc47Q505F5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc47Q505F5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc47Q505F5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc47Q505F5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc47Q505F5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc47Q505F5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc47Q505F5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc47Q505F5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc47Q505F5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc47Q505F5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc47Q505F5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc47Q505F5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc47Q505F5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc47Q505F5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc47Q505F5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc47Q505F5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc47Q505F5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc47Q505F5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc47Q505F5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc47Q505F5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc47Q505F5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc47Q505F5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc47Q505F5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc47Q505F5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc47Q505F5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc47Q505F5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc47Q505F5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc47Q505F5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc47Q505F5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc47Q505F5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc47Q505F5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc47Q505F5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc47Q505F5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc47Q505F5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc47Q505F5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc47Q505F5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc47Q505F5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc47Q505F5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc47Q505F5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc47Q505F5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc47Q505F5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc47Q505F5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc47Q505F5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc47Q505F5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc47Q505F5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc47Q505F5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc47Q505F5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc47Q505F5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc47Q505F5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc47Q505F5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc47Q505F5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc47Q505F5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc47Q505F5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms