Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR50

Vwa5b2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b2Q3UR50 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vwa5b2Q3UR50 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vwa5b2Q3UR50 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vwa5b2Q3UR50 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vwa5b2Q3UR50 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vwa5b2Q3UR50 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vwa5b2Q3UR50 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vwa5b2Q3UR50 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Vwa5b2Q3UR50 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vwa5b2Q3UR50 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vwa5b2Q3UR50 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vwa5b2Q3UR50 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vwa5b2Q3UR50 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vwa5b2Q3UR50 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vwa5b2Q3UR50 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vwa5b2Q3UR50 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vwa5b2Q3UR50 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vwa5b2Q3UR50 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vwa5b2Q3UR50 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vwa5b2Q3UR50 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vwa5b2Q3UR50 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vwa5b2Q3UR50 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vwa5b2Q3UR50 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vwa5b2Q3UR50 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vwa5b2Q3UR50 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vwa5b2Q3UR50 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vwa5b2Q3UR50 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vwa5b2Q3UR50 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vwa5b2Q3UR50 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vwa5b2Q3UR50 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vwa5b2Q3UR50 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vwa5b2Q3UR50 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vwa5b2Q3UR50 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vwa5b2Q3UR50 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vwa5b2Q3UR50 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 210.1 ms