Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3R4

Lmf1, Lipase maturation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmf1Q3U3R4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lmf1Q3U3R4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmf1Q3U3R4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmf1Q3U3R4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lmf1Q3U3R4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lmf1Q3U3R4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmf1Q3U3R4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmf1Q3U3R4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmf1Q3U3R4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmf1Q3U3R4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lmf1Q3U3R4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmf1Q3U3R4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmf1Q3U3R4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmf1Q3U3R4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmf1Q3U3R4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Lmf1Q3U3R4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lmf1Q3U3R4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmf1Q3U3R4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmf1Q3U3R4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmf1Q3U3R4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmf1Q3U3R4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmf1Q3U3R4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmf1Q3U3R4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmf1Q3U3R4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lmf1Q3U3R4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmf1Q3U3R4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmf1Q3U3R4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmf1Q3U3R4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmf1Q3U3R4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmf1Q3U3R4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmf1Q3U3R4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmf1Q3U3R4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmf1Q3U3R4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmf1Q3U3R4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lmf1Q3U3R4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmf1Q3U3R4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmf1Q3U3R4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmf1Q3U3R4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmf1Q3U3R4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmf1Q3U3R4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lmf1Q3U3R4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmf1Q3U3R4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmf1Q3U3R4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmf1Q3U3R4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmf1Q3U3R4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lmf1Q3U3R4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lmf1Q3U3R4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmf1Q3U3R4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmf1Q3U3R4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmf1Q3U3R4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmf1Q3U3R4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmf1Q3U3R4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmf1Q3U3R4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms