Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Calr4Q3TQS0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Calr4Q3TQS0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Calr4Q3TQS0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Calr4Q3TQS0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Calr4Q3TQS0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Calr4Q3TQS0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Calr4Q3TQS0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Calr4Q3TQS0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Calr4Q3TQS0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Calr4Q3TQS0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Calr4Q3TQS0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Calr4Q3TQS0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Calr4Q3TQS0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Calr4Q3TQS0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Calr4Q3TQS0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Calr4Q3TQS0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Calr4Q3TQS0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Calr4Q3TQS0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Calr4Q3TQS0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Calr4Q3TQS0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Calr4Q3TQS0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Calr4Q3TQS0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Calr4Q3TQS0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Calr4Q3TQS0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Calr4Q3TQS0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Calr4Q3TQS0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Calr4Q3TQS0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Calr4Q3TQS0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Calr4Q3TQS0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Calr4Q3TQS0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Calr4Q3TQS0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Calr4Q3TQS0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Calr4Q3TQS0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Calr4Q3TQS0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Calr4Q3TQS0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Calr4Q3TQS0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Calr4Q3TQS0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Calr4Q3TQS0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Calr4Q3TQS0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Calr4Q3TQS0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Calr4Q3TQS0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Calr4Q3TQS0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Calr4Q3TQS0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Calr4Q3TQS0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Calr4Q3TQS0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Calr4Q3TQS0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Calr4Q3TQS0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Calr4Q3TQS0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Calr4Q3TQS0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Calr4Q3TQS0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Calr4Q3TQS0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Calr4Q3TQS0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Calr4Q3TQS0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Calr4Q3TQS0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Calr4Q3TQS0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Calr4Q3TQS0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Calr4Q3TQS0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Calr4Q3TQS0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Calr4Q3TQS0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Calr4Q3TQS0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Calr4Q3TQS0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Calr4Q3TQS0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Calr4Q3TQS0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Calr4Q3TQS0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Calr4Q3TQS0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Calr4Q3TQS0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Calr4Q3TQS0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Calr4Q3TQS0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Calr4Q3TQS0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Calr4Q3TQS0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Calr4Q3TQS0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Calr4Q3TQS0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Calr4Q3TQS0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Calr4Q3TQS0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Calr4Q3TQS0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Calr4Q3TQS0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Calr4Q3TQS0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Calr4Q3TQS0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Calr4Q3TQS0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Calr4Q3TQS0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Calr4Q3TQS0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Calr4Q3TQS0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Calr4Q3TQS0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Calr4Q3TQS0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Calr4Q3TQS0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Calr4Q3TQS0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Calr4Q3TQS0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Calr4Q3TQS0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Calr4Q3TQS0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Calr4Q3TQS0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Calr4Q3TQS0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Calr4Q3TQS0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Calr4Q3TQS0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Calr4Q3TQS0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Calr4Q3TQS0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Calr4Q3TQS0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Calr4Q3TQS0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Calr4Q3TQS0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Calr4Q3TQS0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms