Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR3

Nlrp4c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4cQ3TKR3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlrp4cQ3TKR3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlrp4cQ3TKR3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nlrp4cQ3TKR3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrp4cQ3TKR3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrp4cQ3TKR3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrp4cQ3TKR3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrp4cQ3TKR3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrp4cQ3TKR3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrp4cQ3TKR3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nlrp4cQ3TKR3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlrp4cQ3TKR3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlrp4cQ3TKR3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlrp4cQ3TKR3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlrp4cQ3TKR3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nlrp4cQ3TKR3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrp4cQ3TKR3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrp4cQ3TKR3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrp4cQ3TKR3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrp4cQ3TKR3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrp4cQ3TKR3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrp4cQ3TKR3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrp4cQ3TKR3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nlrp4cQ3TKR3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nlrp4cQ3TKR3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nlrp4cQ3TKR3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nlrp4cQ3TKR3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nlrp4cQ3TKR3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nlrp4cQ3TKR3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nlrp4cQ3TKR3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nlrp4cQ3TKR3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nlrp4cQ3TKR3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrp4cQ3TKR3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrp4cQ3TKR3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrp4cQ3TKR3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrp4cQ3TKR3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nlrp4cQ3TKR3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrp4cQ3TKR3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrp4cQ3TKR3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrp4cQ3TKR3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrp4cQ3TKR3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrp4cQ3TKR3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrp4cQ3TKR3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrp4cQ3TKR3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nlrp4cQ3TKR3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlrp4cQ3TKR3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlrp4cQ3TKR3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlrp4cQ3TKR3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlrp4cQ3TKR3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlrp4cQ3TKR3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nlrp4cQ3TKR3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlrp4cQ3TKR3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlrp4cQ3TKR3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlrp4cQ3TKR3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nlrp4cQ3TKR3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlrp4cQ3TKR3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlrp4cQ3TKR3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlrp4cQ3TKR3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nlrp4cQ3TKR3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nlrp4cQ3TKR3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nlrp4cQ3TKR3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nlrp4cQ3TKR3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nlrp4cQ3TKR3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nlrp4cQ3TKR3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nlrp4cQ3TKR3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms