Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmem248Q3TBN1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmem248Q3TBN1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tmem248Q3TBN1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem248Q3TBN1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem248Q3TBN1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem248Q3TBN1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem248Q3TBN1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem248Q3TBN1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tmem248Q3TBN1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmem248Q3TBN1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmem248Q3TBN1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmem248Q3TBN1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmem248Q3TBN1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tmem248Q3TBN1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem248Q3TBN1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem248Q3TBN1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem248Q3TBN1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem248Q3TBN1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem248Q3TBN1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem248Q3TBN1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tmem248Q3TBN1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem248Q3TBN1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem248Q3TBN1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem248Q3TBN1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem248Q3TBN1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem248Q3TBN1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem248Q3TBN1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tmem248Q3TBN1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmem248Q3TBN1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmem248Q3TBN1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmem248Q3TBN1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmem248Q3TBN1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmem248Q3TBN1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmem248Q3TBN1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tmem248Q3TBN1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmem248Q3TBN1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmem248Q3TBN1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmem248Q3TBN1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmem248Q3TBN1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tmem248Q3TBN1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmem248Q3TBN1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tmem248Q3TBN1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmem248Q3TBN1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmem248Q3TBN1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmem248Q3TBN1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmem248Q3TBN1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmem248Q3TBN1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmem248Q3TBN1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmem248Q3TBN1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmem248Q3TBN1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tmem248Q3TBN1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmem248Q3TBN1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmem248Q3TBN1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmem248Q3TBN1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmem248Q3TBN1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tmem248Q3TBN1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmem248Q3TBN1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmem248Q3TBN1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmem248Q3TBN1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmem248Q3TBN1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmem248Q3TBN1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmem248Q3TBN1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmem248Q3TBN1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmem248Q3TBN1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tmem248Q3TBN1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmem248Q3TBN1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmem248Q3TBN1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tmem248Q3TBN1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmem248Q3TBN1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmem248Q3TBN1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmem248Q3TBN1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmem248Q3TBN1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmem248Q3TBN1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmem248Q3TBN1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmem248Q3TBN1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmem248Q3TBN1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmem248Q3TBN1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmem248Q3TBN1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmem248Q3TBN1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmem248Q3TBN1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmem248Q3TBN1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmem248Q3TBN1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmem248Q3TBN1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmem248Q3TBN1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmem248Q3TBN1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmem248Q3TBN1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmem248Q3TBN1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmem248Q3TBN1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmem248Q3TBN1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmem248Q3TBN1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmem248Q3TBN1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmem248Q3TBN1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmem248Q3TBN1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmem248Q3TBN1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmem248Q3TBN1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmem248Q3TBN1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmem248Q3TBN1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmem248Q3TBN1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmem248Q3TBN1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms