Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SrstQ06666 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrstQ06666 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrstQ06666 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SrstQ06666 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrstQ06666 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SrstQ06666 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrstQ06666 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrstQ06666 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrstQ06666 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SrstQ06666 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrstQ06666 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrstQ06666 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrstQ06666 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SrstQ06666 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SrstQ06666 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SrstQ06666 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrstQ06666 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrstQ06666 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrstQ06666 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrstQ06666 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrstQ06666 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SrstQ06666 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms