Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Top2aQ01320 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Top2aQ01320 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Top2aQ01320 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Top2aQ01320 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Top2aQ01320 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Top2aQ01320 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Top2aQ01320 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Top2aQ01320 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Top2aQ01320 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Top2aQ01320 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Top2aQ01320 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Top2aQ01320 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Top2aQ01320 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Top2aQ01320 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Top2aQ01320 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Top2aQ01320 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Top2aQ01320 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Top2aQ01320 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Top2aQ01320 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Top2aQ01320 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Top2aQ01320 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Top2aQ01320 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Top2aQ01320 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
Top2aQ01320 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Top2aQ01320 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
Top2aQ01320 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Top2aQ01320 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Top2aQ01320 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Top2aQ01320 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Top2aQ01320 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Top2aQ01320 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
Top2aQ01320 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Top2aQ01320 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Top2aQ01320 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Top2aQ01320 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Top2aQ01320 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Top2aQ01320 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Top2aQ01320 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Top2aQ01320 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Top2aQ01320 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Top2aQ01320 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Top2aQ01320 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Top2aQ01320 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Top2aQ01320 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Top2aQ01320 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Top2aQ01320 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Top2aQ01320 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Top2aQ01320 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Top2aQ01320 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Top2aQ01320 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Top2aQ01320 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Top2aQ01320 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Top2aQ01320 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Top2aQ01320 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Top2aQ01320 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Top2aQ01320 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
Top2aQ01320 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Top2aQ01320 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Top2aQ01320 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Top2aQ01320 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Top2aQ01320 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Top2aQ01320 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Top2aQ01320 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
Top2aQ01320 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Top2aQ01320 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Top2aQ01320 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
Top2aQ01320 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Top2aQ01320 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Top2aQ01320 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
Top2aQ01320 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Top2aQ01320 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Top2aQ01320 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Top2aQ01320 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Top2aQ01320 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Top2aQ01320 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Top2aQ01320 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Top2aQ01320 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Top2aQ01320 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Top2aQ01320 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Top2aQ01320 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Top2aQ01320 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Top2aQ01320 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Top2aQ01320 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Top2aQ01320 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Top2aQ01320 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Top2aQ01320 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Top2aQ01320 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Top2aQ01320 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Top2aQ01320 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Top2aQ01320 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Top2aQ01320 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Top2aQ01320 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Top2aQ01320 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Top2aQ01320 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Top2aQ01320 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Top2aQ01320 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Top2aQ01320 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Top2aQ01320 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Top2aQ01320 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms