Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbp1Q00915 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbp1Q00915 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbp1Q00915 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbp1Q00915 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbp1Q00915 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbp1Q00915 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbp1Q00915 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbp1Q00915 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbp1Q00915 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbp1Q00915 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbp1Q00915 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbp1Q00915 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbp1Q00915 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbp1Q00915 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbp1Q00915 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbp1Q00915 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbp1Q00915 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbp1Q00915 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbp1Q00915 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbp1Q00915 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbp1Q00915 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbp1Q00915 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbp1Q00915 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbp1Q00915 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbp1Q00915 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbp1Q00915 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbp1Q00915 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbp1Q00915 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbp1Q00915 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbp1Q00915 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbp1Q00915 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbp1Q00915 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbp1Q00915 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbp1Q00915 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbp1Q00915 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rbp1Q00915 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbp1Q00915 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rbp1Q00915 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rbp1Q00915 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Rbp1Q00915 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rbp1Q00915 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rbp1Q00915 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rbp1Q00915 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rbp1Q00915 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbp1Q00915 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbp1Q00915 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbp1Q00915 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms