Protein–RNA interactions for Protein: P70663

Sparcl1, SPARC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sparcl1P70663 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sparcl1P70663 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Sparcl1P70663 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sparcl1P70663 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sparcl1P70663 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sparcl1P70663 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sparcl1P70663 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sparcl1P70663 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sparcl1P70663 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sparcl1P70663 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sparcl1P70663 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sparcl1P70663 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sparcl1P70663 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sparcl1P70663 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sparcl1P70663 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sparcl1P70663 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sparcl1P70663 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sparcl1P70663 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sparcl1P70663 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sparcl1P70663 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sparcl1P70663 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sparcl1P70663 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sparcl1P70663 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sparcl1P70663 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sparcl1P70663 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sparcl1P70663 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sparcl1P70663 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sparcl1P70663 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sparcl1P70663 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sparcl1P70663 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sparcl1P70663 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sparcl1P70663 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sparcl1P70663 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sparcl1P70663 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sparcl1P70663 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sparcl1P70663 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sparcl1P70663 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sparcl1P70663 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sparcl1P70663 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sparcl1P70663 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sparcl1P70663 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sparcl1P70663 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sparcl1P70663 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sparcl1P70663 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sparcl1P70663 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sparcl1P70663 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sparcl1P70663 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sparcl1P70663 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sparcl1P70663 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sparcl1P70663 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sparcl1P70663 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sparcl1P70663 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sparcl1P70663 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sparcl1P70663 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sparcl1P70663 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sparcl1P70663 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sparcl1P70663 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sparcl1P70663 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Sparcl1P70663 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sparcl1P70663 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sparcl1P70663 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sparcl1P70663 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sparcl1P70663 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sparcl1P70663 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sparcl1P70663 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sparcl1P70663 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sparcl1P70663 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sparcl1P70663 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sparcl1P70663 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sparcl1P70663 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sparcl1P70663 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sparcl1P70663 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sparcl1P70663 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sparcl1P70663 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sparcl1P70663 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sparcl1P70663 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sparcl1P70663 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sparcl1P70663 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sparcl1P70663 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sparcl1P70663 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sparcl1P70663 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sparcl1P70663 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sparcl1P70663 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sparcl1P70663 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sparcl1P70663 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sparcl1P70663 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sparcl1P70663 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sparcl1P70663 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Sparcl1P70663 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sparcl1P70663 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sparcl1P70663 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sparcl1P70663 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sparcl1P70663 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sparcl1P70663 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sparcl1P70663 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sparcl1P70663 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sparcl1P70663 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sparcl1P70663 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sparcl1P70663 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sparcl1P70663 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms