Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tp53bp1P70399 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tp53bp1P70399 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tp53bp1P70399 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tp53bp1P70399 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tp53bp1P70399 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tp53bp1P70399 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tp53bp1P70399 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tp53bp1P70399 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tp53bp1P70399 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tp53bp1P70399 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tp53bp1P70399 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tp53bp1P70399 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tp53bp1P70399 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tp53bp1P70399 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tp53bp1P70399 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tp53bp1P70399 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tp53bp1P70399 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tp53bp1P70399 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tp53bp1P70399 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tp53bp1P70399 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tp53bp1P70399 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tp53bp1P70399 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tp53bp1P70399 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tp53bp1P70399 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tp53bp1P70399 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tp53bp1P70399 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tp53bp1P70399 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tp53bp1P70399 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tp53bp1P70399 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tp53bp1P70399 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tp53bp1P70399 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tp53bp1P70399 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tp53bp1P70399 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tp53bp1P70399 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tp53bp1P70399 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tp53bp1P70399 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tp53bp1P70399 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tp53bp1P70399 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tp53bp1P70399 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tp53bp1P70399 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tp53bp1P70399 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tp53bp1P70399 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tp53bp1P70399 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tp53bp1P70399 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tp53bp1P70399 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tp53bp1P70399 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tp53bp1P70399 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tp53bp1P70399 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tp53bp1P70399 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tp53bp1P70399 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tp53bp1P70399 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tp53bp1P70399 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tp53bp1P70399 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tp53bp1P70399 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tp53bp1P70399 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tp53bp1P70399 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tp53bp1P70399 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tp53bp1P70399 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tp53bp1P70399 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tp53bp1P70399 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tp53bp1P70399 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tp53bp1P70399 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tp53bp1P70399 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tp53bp1P70399 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tp53bp1P70399 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tp53bp1P70399 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tp53bp1P70399 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tp53bp1P70399 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Tp53bp1P70399 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tp53bp1P70399 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tp53bp1P70399 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tp53bp1P70399 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tp53bp1P70399 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tp53bp1P70399 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tp53bp1P70399 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tp53bp1P70399 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tp53bp1P70399 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tp53bp1P70399 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tp53bp1P70399 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tp53bp1P70399 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tp53bp1P70399 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tp53bp1P70399 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tp53bp1P70399 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tp53bp1P70399 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tp53bp1P70399 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tp53bp1P70399 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tp53bp1P70399 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tp53bp1P70399 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tp53bp1P70399 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tp53bp1P70399 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tp53bp1P70399 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tp53bp1P70399 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tp53bp1P70399 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tp53bp1P70399 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tp53bp1P70399 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tp53bp1P70399 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tp53bp1P70399 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tp53bp1P70399 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tp53bp1P70399 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms