Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lim2P56563 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lim2P56563 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Lim2P56563 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lim2P56563 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lim2P56563 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lim2P56563 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lim2P56563 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lim2P56563 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lim2P56563 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lim2P56563 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lim2P56563 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Lim2P56563 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lim2P56563 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lim2P56563 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lim2P56563 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lim2P56563 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lim2P56563 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lim2P56563 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lim2P56563 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lim2P56563 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lim2P56563 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lim2P56563 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lim2P56563 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lim2P56563 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lim2P56563 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lim2P56563 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lim2P56563 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lim2P56563 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lim2P56563 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lim2P56563 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lim2P56563 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lim2P56563 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lim2P56563 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lim2P56563 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lim2P56563 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lim2P56563 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lim2P56563 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lim2P56563 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lim2P56563 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lim2P56563 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lim2P56563 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lim2P56563 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lim2P56563 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lim2P56563 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lim2P56563 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lim2P56563 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lim2P56563 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lim2P56563 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lim2P56563 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lim2P56563 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lim2P56563 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lim2P56563 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lim2P56563 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lim2P56563 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lim2P56563 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lim2P56563 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms