Protein–RNA interactions for Protein: P49919

Cdkn1c, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1cP49919 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdkn1cP49919 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdkn1cP49919 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdkn1cP49919 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdkn1cP49919 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdkn1cP49919 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdkn1cP49919 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdkn1cP49919 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdkn1cP49919 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdkn1cP49919 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdkn1cP49919 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cdkn1cP49919 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cdkn1cP49919 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdkn1cP49919 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdkn1cP49919 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdkn1cP49919 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdkn1cP49919 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdkn1cP49919 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdkn1cP49919 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdkn1cP49919 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdkn1cP49919 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdkn1cP49919 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdkn1cP49919 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdkn1cP49919 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdkn1cP49919 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdkn1cP49919 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdkn1cP49919 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdkn1cP49919 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdkn1cP49919 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdkn1cP49919 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdkn1cP49919 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdkn1cP49919 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdkn1cP49919 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdkn1cP49919 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdkn1cP49919 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdkn1cP49919 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdkn1cP49919 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdkn1cP49919 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdkn1cP49919 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdkn1cP49919 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdkn1cP49919 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdkn1cP49919 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cdkn1cP49919 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdkn1cP49919 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdkn1cP49919 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdkn1cP49919 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdkn1cP49919 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdkn1cP49919 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdkn1cP49919 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdkn1cP49919 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdkn1cP49919 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdkn1cP49919 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdkn1cP49919 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdkn1cP49919 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdkn1cP49919 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdkn1cP49919 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdkn1cP49919 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdkn1cP49919 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdkn1cP49919 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdkn1cP49919 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdkn1cP49919 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdkn1cP49919 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdkn1cP49919 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdkn1cP49919 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdkn1cP49919 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdkn1cP49919 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdkn1cP49919 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdkn1cP49919 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdkn1cP49919 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdkn1cP49919 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdkn1cP49919 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdkn1cP49919 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdkn1cP49919 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdkn1cP49919 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdkn1cP49919 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdkn1cP49919 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdkn1cP49919 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdkn1cP49919 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdkn1cP49919 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdkn1cP49919 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdkn1cP49919 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdkn1cP49919 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdkn1cP49919 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdkn1cP49919 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdkn1cP49919 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdkn1cP49919 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdkn1cP49919 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdkn1cP49919 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdkn1cP49919 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdkn1cP49919 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdkn1cP49919 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdkn1cP49919 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdkn1cP49919 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdkn1cP49919 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdkn1cP49919 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdkn1cP49919 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdkn1cP49919 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdkn1cP49919 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdkn1cP49919 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdkn1cP49919 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms