Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PdgfraP26618 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PdgfraP26618 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PdgfraP26618 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PdgfraP26618 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PdgfraP26618 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PdgfraP26618 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PdgfraP26618 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PdgfraP26618 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PdgfraP26618 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PdgfraP26618 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PdgfraP26618 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PdgfraP26618 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PdgfraP26618 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PdgfraP26618 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PdgfraP26618 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PdgfraP26618 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PdgfraP26618 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PdgfraP26618 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PdgfraP26618 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PdgfraP26618 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PdgfraP26618 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PdgfraP26618 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PdgfraP26618 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PdgfraP26618 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PdgfraP26618 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PdgfraP26618 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PdgfraP26618 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PdgfraP26618 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PdgfraP26618 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PdgfraP26618 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PdgfraP26618 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PdgfraP26618 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PdgfraP26618 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PdgfraP26618 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PdgfraP26618 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PdgfraP26618 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms