Protein–RNA interactions for Protein: P11031

Sub1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sub1P11031 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sub1P11031 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sub1P11031 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sub1P11031 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sub1P11031 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sub1P11031 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sub1P11031 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sub1P11031 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sub1P11031 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sub1P11031 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sub1P11031 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sub1P11031 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sub1P11031 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sub1P11031 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sub1P11031 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sub1P11031 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sub1P11031 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sub1P11031 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sub1P11031 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sub1P11031 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sub1P11031 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sub1P11031 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sub1P11031 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sub1P11031 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sub1P11031 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sub1P11031 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sub1P11031 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sub1P11031 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sub1P11031 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sub1P11031 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sub1P11031 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sub1P11031 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sub1P11031 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sub1P11031 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sub1P11031 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sub1P11031 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sub1P11031 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sub1P11031 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sub1P11031 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sub1P11031 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sub1P11031 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sub1P11031 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sub1P11031 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sub1P11031 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sub1P11031 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sub1P11031 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sub1P11031 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sub1P11031 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sub1P11031 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sub1P11031 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sub1P11031 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sub1P11031 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sub1P11031 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sub1P11031 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sub1P11031 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sub1P11031 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sub1P11031 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sub1P11031 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sub1P11031 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sub1P11031 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sub1P11031 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sub1P11031 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms